271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5044 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  65.64 
 
 		 527 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  71.51 
 
 		 541 aa  741    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  66.03 
 
 		 527 aa  660    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  72.87 
 
 		 549 aa  746    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  100 
 
 		 535 aa  1071    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  73.75 
 
 		 541 aa  738    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  63.25 
 
 		 533 aa  643    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  74.07 
 
 		 569 aa  736    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  73.69 
 
 		 569 aa  714    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  80.38 
 
 		 532 aa  824    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  72.87 
 
 		 549 aa  746    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  68 
 
 		 528 aa  677    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  74.58 
 
 		 568 aa  740    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  68.14 
 
 		 527 aa  677    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  74.02 
 
 		 555 aa  748    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  73.83 
 
 		 541 aa  747    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  74.58 
 
 		 568 aa  740    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  64.11 
 
 		 533 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  65.48 
 
 		 527 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  60.48 
 
 		 535 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  59.85 
 
 		 528 aa  587  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  59.47 
 
 		 525 aa  581  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  51.6 
 
 		 539 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  67.05 
 
 		 411 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  49.53 
 
 		 774 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  47.48 
 
 		 739 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  43.61 
 
 		 545 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  44.42 
 
 		 555 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  43.34 
 
 		 529 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  43.76 
 
 		 551 aa  349  7e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  41.87 
 
 		 529 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  42.44 
 
 		 548 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  42.1 
 
 		 530 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  40.35 
 
 		 931 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  40.88 
 
 		 528 aa  320  5e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  42.07 
 
 		 538 aa  319  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 523 aa  315  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  40.88 
 
 		 531 aa  312  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  37.38 
 
 		 526 aa  313  6.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  40.69 
 
 		 896 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  38.57 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  38.94 
 
 		 361 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  35.97 
 
 		 521 aa  211  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  29.17 
 
 		 549 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  25.44 
 
 		 247 aa  72  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 265 aa  67  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  26.6 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  24.79 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  29.08 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  22.82 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1183  Rhodanese domain protein  28.79 
 
 		 279 aa  59.3  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.915724  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  25.9 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 		 126 aa  57.4  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  35.45 
 
 		 135 aa  57  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  23.3 
 
 		 423 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 		 480 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  37.25 
 
 		 119 aa  56.6  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  41.38 
 
 		 126 aa  55.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 122 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  22.12 
 
 		 388 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  24.11 
 
 		 617 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  29.73 
 
 		 141 aa  55.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.11 
 
 		 389 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  25.36 
 
 		 230 aa  54.3  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  35.45 
 
 		 126 aa  54.3  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  39.74 
 
 		 116 aa  53.5  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.88 
 
 		 478 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 		 467 aa  53.5  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  23.01 
 
 		 252 aa  53.5  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  32.47 
 
 		 346 aa  53.5  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  26.46 
 
 		 472 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  25.84 
 
 		 99 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  27.93 
 
 		 123 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  22.29 
 
 		 454 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 		 138 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 		 113 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 143 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  25.74 
 
 		 305 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  42 
 
 		 361 aa  51.6  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0417  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 		 166 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.678691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 114 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  35.79 
 
 		 140 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 		 282 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  40.62 
 
 		 301 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 277 aa  51.2  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 135 aa  50.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  23.53 
 
 		 377 aa  50.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  40.26 
 
 		 130 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 		 189 aa  50.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  42.42 
 
 		 120 aa  50.4  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  39.51 
 
 		 127 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  36.96 
 
 		 132 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 		 124 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  28.5 
 
 		 479 aa  50.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  23.78 
 
 		 406 aa  50.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 		 127 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2629  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 		 108 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>