195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4136 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  69.7 
 
 
551 aa  713    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
528 aa  1064    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  85.71 
 
 
531 aa  830    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  73.3 
 
 
523 aa  744    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  62.31 
 
 
529 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  62.31 
 
 
529 aa  621  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  60.15 
 
 
530 aa  578  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  59.01 
 
 
931 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  57.3 
 
 
538 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  57.82 
 
 
896 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  51.89 
 
 
548 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
526 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  42.91 
 
 
527 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  44.49 
 
 
525 aa  360  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  43.03 
 
 
527 aa  358  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  44 
 
 
528 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  43.27 
 
 
535 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  43.36 
 
 
549 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  43.36 
 
 
549 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  41.87 
 
 
527 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  43.72 
 
 
527 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  41.78 
 
 
533 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  41.8 
 
 
533 aa  335  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  41.07 
 
 
535 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  42.12 
 
 
532 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  41.13 
 
 
545 aa  323  5e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  40.11 
 
 
774 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  39.88 
 
 
528 aa  311  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  42.14 
 
 
569 aa  310  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  40.75 
 
 
539 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  39.82 
 
 
739 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  41.38 
 
 
541 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  40.6 
 
 
555 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  41.27 
 
 
541 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  40.81 
 
 
569 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  42.24 
 
 
568 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  42.24 
 
 
568 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  42.04 
 
 
541 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  42.62 
 
 
411 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  38.42 
 
 
555 aa  263  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  37.74 
 
 
380 aa  232  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  39.08 
 
 
361 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  34.1 
 
 
521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  31.19 
 
 
549 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  25.6 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  26.92 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  23.96 
 
 
377 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  28.96 
 
 
216 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  23.71 
 
 
432 aa  63.5  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  38.26 
 
 
116 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  25.88 
 
 
265 aa  61.2  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  33 
 
 
185 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7246  rhodanese-related sulfurtransferase  32 
 
 
279 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0149117  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  33.65 
 
 
124 aa  58.5  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.21 
 
 
289 aa  58.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  32.69 
 
 
124 aa  57  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  26.41 
 
 
617 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  23.08 
 
 
252 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  24.32 
 
 
454 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  29.41 
 
 
136 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  23.74 
 
 
406 aa  55.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.36 
 
 
389 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  28.23 
 
 
220 aa  54.3  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.99 
 
 
289 aa  53.9  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  33.9 
 
 
119 aa  53.5  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  29.9 
 
 
115 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  33 
 
 
177 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  32.38 
 
 
186 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  27.13 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.96 
 
 
388 aa  52.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  27.68 
 
 
123 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0892  Rhodanese domain protein  35.34 
 
 
125 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  36.76 
 
 
124 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  26.67 
 
 
123 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  30.84 
 
 
129 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  31.63 
 
 
144 aa  51.6  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  31.78 
 
 
218 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  27.18 
 
 
127 aa  50.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  42.53 
 
 
276 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  26.6 
 
 
99 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.9 
 
 
392 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  29.57 
 
 
123 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  38.82 
 
 
479 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5322  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.62 
 
 
281 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.710111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 
189 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  31.39 
 
 
346 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 
459 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  28.97 
 
 
129 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.08 
 
 
393 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  25.25 
 
 
99 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  34.88 
 
 
466 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  34.78 
 
 
142 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  42.53 
 
 
276 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  34.62 
 
 
128 aa  48.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
128 aa  48.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  36.9 
 
 
103 aa  48.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  30.28 
 
 
438 aa  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  35.79 
 
 
288 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  29 
 
 
282 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
189 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>