121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2238 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 276 aa  550  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  93.84 
 
 		 276 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  84 
 
 		 276 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  73.53 
 
 		 276 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  73.63 
 
 		 276 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  72.89 
 
 		 276 aa  394  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  70.7 
 
 		 276 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  71.17 
 
 		 272 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  70.33 
 
 		 276 aa  384  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  69.37 
 
 		 273 aa  377  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  70.7 
 
 		 271 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  69.23 
 
 		 271 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  68.1 
 
 		 277 aa  363  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  64.94 
 
 		 272 aa  345  6e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  62.41 
 
 		 275 aa  331  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  63.08 
 
 		 281 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  63.08 
 
 		 281 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  56.77 
 
 		 152 aa  178  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  58.28 
 
 		 152 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  42.91 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  61.31 
 
 		 205 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  61.31 
 
 		 205 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  61.31 
 
 		 205 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  61.31 
 
 		 205 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  61.31 
 
 		 205 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  53.38 
 
 		 157 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  52.7 
 
 		 157 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  52.7 
 
 		 157 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  61.31 
 
 		 142 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  53.38 
 
 		 182 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  61.31 
 
 		 142 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  55.24 
 
 		 143 aa  158  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  55.8 
 
 		 140 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  53.42 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  48.67 
 
 		 150 aa  149  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  48.61 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  51.35 
 
 		 156 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  48.37 
 
 		 155 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  46.53 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.36 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  55.47 
 
 		 128 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  44.93 
 
 		 144 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  34.75 
 
 		 146 aa  87.8  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  37.04 
 
 		 139 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  31.97 
 
 		 328 aa  79  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1227  hypothetical protein  39.26 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  41.84 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  31.37 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  29.05 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  35.58 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  35.58 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  38.57 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  37.34 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  34.53 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  33.33 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  35.61 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  34.38 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  33.79 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  33.74 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  36.31 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  36.31 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  36.31 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  36.31 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  36.31 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  36.31 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  32.62 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  35.67 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  33.12 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  37.91 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  36 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  34.38 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  35.54 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  33.72 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  35.37 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2449  hypothetical protein  51.72 
 
 		 93 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.941698  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  33.75 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  33.75 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  31.55 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  30.52 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  42.35 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  36.76 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2657  rhodanese-like protein  38.37 
 
 		 125 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  36.9 
 
 		 181 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 		 106 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  40.48 
 
 		 115 aa  49.7  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 161 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  32.93 
 
 		 538 aa  48.9  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  39.29 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  32.69 
 
 		 113 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  37.96 
 
 		 116 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  41.46 
 
 		 98 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 		 140 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  41.46 
 
 		 98 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 145 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 223 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  30.1 
 
 		 379 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  33.73 
 
 		 173 aa  46.2  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  36.47 
 
 		 269 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  35.65 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 528 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>