100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6163 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  551  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  85.45 
 
 		 276 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  84 
 
 		 276 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  70.22 
 
 		 276 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  70.7 
 
 		 271 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  72.53 
 
 		 271 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  69.6 
 
 		 276 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  68.86 
 
 		 276 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  69.34 
 
 		 272 aa  374  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  67.9 
 
 		 273 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  67.4 
 
 		 276 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  67.03 
 
 		 276 aa  368  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  66.31 
 
 		 277 aa  354  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  64.21 
 
 		 272 aa  342  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  62.37 
 
 		 281 aa  322  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  62.37 
 
 		 281 aa  322  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  60.58 
 
 		 275 aa  315  7e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  42.91 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  56.95 
 
 		 152 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  54.84 
 
 		 152 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  49.09 
 
 		 182 aa  165  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  57.75 
 
 		 205 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  57.75 
 
 		 205 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  57.75 
 
 		 205 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  57.75 
 
 		 205 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  57.75 
 
 		 205 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  59.12 
 
 		 142 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  59.12 
 
 		 142 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  53.15 
 
 		 143 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  55.8 
 
 		 140 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  49.32 
 
 		 157 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  49.32 
 
 		 157 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  49.31 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  46.67 
 
 		 150 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  47.77 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  50.68 
 
 		 156 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  47.71 
 
 		 155 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  47.22 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  55.47 
 
 		 128 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  43.75 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  42.75 
 
 		 144 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  34.75 
 
 		 146 aa  89  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  31.82 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  38.52 
 
 		 139 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  31.8 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1227  hypothetical protein  38.89 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  32.68 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  34 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  30.8 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  33.99 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  33.56 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  37.16 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  39.01 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  36.47 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  35.85 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  35.85 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  35.85 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  35.85 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  35.85 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  35.85 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  34.81 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  31.25 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  34.81 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  35.22 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  37.86 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  34.59 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  32.75 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  31.58 
 
 		 323 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  35.66 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  36.43 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  33.54 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  36.62 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  33.13 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2449  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.941698  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  32.53 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  32.53 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  36.22 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  42.53 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  30.77 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  33.1 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  34.62 
 
 		 113 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2657  rhodanese-like protein  38.1 
 
 		 125 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  36.47 
 
 		 106 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  39.76 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  36.71 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 173 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 		 140 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  29.7 
 
 		 379 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  35.19 
 
 		 132 aa  45.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 223 aa  45.4  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 		 141 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  30.95 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 107 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 227 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1047  Rhodanese domain protein  37.18 
 
 		 185 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 140 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 		 222 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  34.18 
 
 		 115 aa  42.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.49 
 
 		 813 aa  42.4  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>