63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0093 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 106 aa  213  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2676  Rhodanese domain protein  40.57 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2657  rhodanese-like protein  41.49 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  42.31 
 
 		 308 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1047  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 185 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  39.36 
 
 		 273 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2246  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00449361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  37.93 
 
 		 302 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  35 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2448  rhodanese-like protein  35.53 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38806  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  35.79 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  35.42 
 
 		 272 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  29.59 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 		 281 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 		 281 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  37.89 
 
 		 276 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  32.29 
 
 		 272 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  35.79 
 
 		 276 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 		 276 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 		 397 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  39.68 
 
 		 268 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 		 282 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  36.47 
 
 		 276 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 		 271 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 		 400 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 		 276 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 277 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  36.36 
 
 		 330 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 		 276 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  33.33 
 
 		 330 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 		 276 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  26.74 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  39.68 
 
 		 330 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  39.68 
 
 		 330 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  34.83 
 
 		 330 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  26.47 
 
 		 379 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4316  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 397 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558515  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 331 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  32.18 
 
 		 272 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  30.21 
 
 		 277 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  32.65 
 
 		 297 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0390  rhodanese-like protein  29.29 
 
 		 378 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  26.8 
 
 		 279 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0492  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.48 
 
 		 407 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  29.47 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 		 278 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 		 562 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  32.14 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  38.1 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  38.1 
 
 		 331 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 		 277 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0794  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase/rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 		 558 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4642  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.845465  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0021  rhodanese domain-containing protein  37.74 
 
 		 223 aa  40.8  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.45235  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  30.1 
 
 		 325 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  31.71 
 
 		 271 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.3 
 
 		 471 aa  40.4  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  30.16 
 
 		 329 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  33.33 
 
 		 328 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  32.29 
 
 		 330 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>