78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4254 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  294  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  64.03 
 
 
141 aa  194  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  43.57 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  42.65 
 
 
333 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  41.3 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  41.35 
 
 
328 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  39.06 
 
 
313 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  39.84 
 
 
313 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  43.26 
 
 
205 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  43.26 
 
 
205 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  42.76 
 
 
142 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  43.26 
 
 
142 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  43.26 
 
 
205 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  40.3 
 
 
139 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  43.26 
 
 
205 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  43.26 
 
 
205 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  38.97 
 
 
287 aa  97.1  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 
288 aa  97.1  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  41.3 
 
 
285 aa  96.7  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  40.15 
 
 
325 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  40 
 
 
325 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  40 
 
 
325 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  40.15 
 
 
325 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  40.15 
 
 
331 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  40.15 
 
 
325 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  40.15 
 
 
303 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  40.15 
 
 
273 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  40.15 
 
 
303 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  41.13 
 
 
143 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  39.86 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  39.1 
 
 
335 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  32.35 
 
 
316 aa  90.1  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  35.4 
 
 
363 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  37.86 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  43.48 
 
 
281 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  43.48 
 
 
281 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  39.29 
 
 
140 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  37.68 
 
 
297 aa  87.8  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.06 
 
 
285 aa  87.8  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  38.58 
 
 
312 aa  87  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  36.72 
 
 
309 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  37.12 
 
 
273 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  37.04 
 
 
320 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  37.04 
 
 
320 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  42.75 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  39.57 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  40.77 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  36.57 
 
 
324 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  34.85 
 
 
332 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  38.3 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  36.84 
 
 
320 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  36.84 
 
 
320 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  38.3 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  38.46 
 
 
323 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  35.43 
 
 
306 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  38.3 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  38.3 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  39.86 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  34.81 
 
 
323 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  35.34 
 
 
320 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  38.69 
 
 
271 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  34.07 
 
 
320 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  36.88 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  37.68 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  39.29 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  34.85 
 
 
324 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  32.33 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  35.04 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  37.41 
 
 
273 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  38.57 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  36.69 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  36.69 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  36.69 
 
 
276 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  35.51 
 
 
276 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  37.86 
 
 
276 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  36.69 
 
 
276 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  36.43 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  32.61 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.327811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>