78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0097 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0097  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  284  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1349  Chromate resistance exported protein  37.86 
 
 		 146 aa  104  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  42.96 
 
 		 288 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1533  putative chromate resistance protein  41.04 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4254  hypothetical protein  40.3 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  38.81 
 
 		 285 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2153  hypothetical protein  39.55 
 
 		 150 aa  96.7  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.594217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.56 
 
 		 285 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0357  hypothetical protein  38.06 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721844  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5141  ChrB protein  37.78 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0082  ChrB protein  38.06 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1492  hypothetical protein  38.06 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0065  hypothetical protein  37.78 
 
 		 205 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0065  ChrB protein  37.78 
 
 		 205 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1209  hypothetical protein  37.78 
 
 		 205 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1562  hypothetical protein  37.78 
 
 		 205 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0054  hypothetical protein  37.78 
 
 		 205 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1204  hypothetical protein  36.3 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  34.97 
 
 		 287 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  39.1 
 
 		 272 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3864  chromate resistance regulator  35.04 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  36.3 
 
 		 297 aa  88.2  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5589  hypothetical protein  34.31 
 
 		 157 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5953  hypothetical protein  34.31 
 
 		 157 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6199  hypothetical protein  35.56 
 
 		 140 aa  87.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558934 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6454  hypothetical protein  34.31 
 
 		 157 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  38.35 
 
 		 277 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  37.31 
 
 		 276 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  36.57 
 
 		 276 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  38.52 
 
 		 276 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  37.59 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  37.59 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  34.59 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2525  hypothetical protein  36.03 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  36.57 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 		 276 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 		 276 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 		 276 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  36.09 
 
 		 271 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5223  chromate resistance regulator  29.85 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.327811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  34.06 
 
 		 276 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03923  hypothetical protein  33.09 
 
 		 182 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5158  hypothetical protein  33.09 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3383  hypothetical protein  32.35 
 
 		 313 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431478  hitchhiker  0.00234809 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2539  hypothetical protein  37.5 
 
 		 275 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2446  chromate resistance exported protein  31.85 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  33.08 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5156  hypothetical protein  34.11 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2524  ChrB protein  32.31 
 
 		 328 aa  71.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2675  ChrB protein  31.78 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4366  chromate resistance exported protein  32.03 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  32.84 
 
 		 273 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3199  chromate resistance exported protein  32.84 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3866  chromate resistance regulator  34.07 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6456  putative chromate resistance signal peptide protein  33.58 
 
 		 320 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5054  chromate resistance exported protein  31.34 
 
 		 325 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5591  putative chromate resistance signal peptide protein  34.33 
 
 		 320 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5955  putative chromate resistance signal peptide protein  34.33 
 
 		 320 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0687386 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2248  hypothetical protein  29.2 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0554  chromate resistance signal peptide protein  34.07 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0496701 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3192  chromate resistance exported protein  28.46 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1207  putative chromate resistance protein  33.33 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.609429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6203  putative chromate resistance signal peptide protein  28.47 
 
 		 324 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.941608  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5138  chromate resistance exported protein  30.6 
 
 		 332 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374777  normal  0.563482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3250  putative chromate resistance signal peptide protein  31.85 
 
 		 320 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3573  putative chromate resistance signal peptide protein  31.85 
 
 		 320 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.771292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0085  chrB protein  31.85 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0056  chromate resistance protein ChrB  31.85 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0069  chromate resistance protein ChrB  31.85 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1564  chromate resistance exported protein  31.85 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1802  putative chromate resistance protein  30.6 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0068  chrB protein  31.85 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1213  chromate resistance protein ChrB  31.85 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1496  chromate resistance protein ChrB  31.85 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0074  chromate resistance protein ChrB  31.85 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0082  Chromate resistance exported protein  33.64 
 
 		 323 aa  57.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1522  chromate resistance signal peptide protein  31.01 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320502  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2805  ChrB protein  27.89 
 
 		 363 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>