More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5758 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  100 
 
 		 308 aa  617  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  58.75 
 
 		 305 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  56.15 
 
 		 302 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6201  manganese and iron superoxide dismutase  65.28 
 
 		 197 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555386 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7990  manganese and iron superoxide dismutase  63.64 
 
 		 205 aa  245  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0509196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2234  manganese and iron superoxide dismutase  64.48 
 
 		 205 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2529  manganese and iron superoxide dismutase  59.18 
 
 		 197 aa  236  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.507658  normal  0.528937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6159  manganese and iron superoxide dismutase  60 
 
 		 204 aa  235  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2537  manganese and iron superoxide dismutase  62.16 
 
 		 224 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4364  manganese and iron superoxide dismutase  47.03 
 
 		 203 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0235641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1781  manganese and iron superoxide dismutase  47.94 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0840  manganese and iron superoxide dismutase  37.16 
 
 		 192 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00121294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1158  superoxide dismutase  39.34 
 
 		 192 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000413259  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0956  superoxide dismutase  36.61 
 
 		 192 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1258  Superoxide dismutase  32.67 
 
 		 244 aa  99.8  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.651957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1453  manganese and iron superoxide dismutase  37.16 
 
 		 192 aa  99.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.46198  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0075  Superoxide dismutase  31.61 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_827  superoxide dismutase  35.33 
 
 		 192 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0145605  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  35.29 
 
 		 199 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  33.5 
 
 		 205 aa  95.9  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2410  manganese and iron superoxide dismutase  37.36 
 
 		 192 aa  95.9  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000430969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2204  manganese and iron superoxide dismutase  34.07 
 
 		 194 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000605082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2022  manganese and iron superoxide dismutase  34.62 
 
 		 194 aa  93.2  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000363607 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  34.47 
 
 		 200 aa  92.8  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  34.47 
 
 		 200 aa  90.1  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2101  manganese and iron superoxide dismutase  30.81 
 
 		 209 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  34.8 
 
 		 200 aa  87  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2012  manganese and iron superoxide dismutase  35.71 
 
 		 201 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1927  manganese and iron superoxide dismutase  35.71 
 
 		 201 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.241942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1952  manganese and iron superoxide dismutase  35.71 
 
 		 201 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.777519  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  33.99 
 
 		 203 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1904  manganese and iron superoxide dismutase  35.03 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  32.12 
 
 		 209 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  32.31 
 
 		 208 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  32 
 
 		 226 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  31.5 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  33.5 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  32.66 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1898  superoxide dismutase  31.91 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1574  manganese and iron superoxide dismutase  31.91 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  30.1 
 
 		 205 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  29.27 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 		 106 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1129  superoxide dismutase  26.29 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0395543  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2657  rhodanese-like protein  41.46 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  30.61 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  31.34 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  42.68 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  27.23 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2595  superoxide dismutase  28.7 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.765686  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  30.65 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2246  rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 		 107 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00449361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1047  Rhodanese domain protein  44.87 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  29.32 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  28.72 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  29.53 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  26.63 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00022  superoxide dismutase  28.89 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00410451  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  27.84 
 
 		 211 aa  72  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0214  superoxide dismutase  26.73 
 
 		 208 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  26.83 
 
 		 193 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0328  superoxide dismutase (Fe)  27.92 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.731602  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2448  rhodanese-like protein  42.5 
 
 		 123 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38806  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  26.7 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  30 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  26.7 
 
 		 198 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3359  Superoxide dismutase  33.33 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000950604  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  27.32 
 
 		 193 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  29.17 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1312  superoxide dismutase (Fe)  26.94 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000018669  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  26.7 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  27.32 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  29.13 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  30.57 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  29.51 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2676  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 106 aa  70.5  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  27.69 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  26.42 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  26.83 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  26.21 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  28.12 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  26.34 
 
 		 193 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  33.52 
 
 		 204 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  28.19 
 
 		 200 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  30.32 
 
 		 209 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  28.22 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1251  Mn/Fe superoxide dismutase  27 
 
 		 227 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.275789  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  26.92 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  25.5 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  30.73 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  28.12 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  26.92 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  24.87 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  25.5 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  25.5 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0845  Superoxide dismutase  26.32 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  25.5 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  25.5 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  25.5 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  27.46 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>