More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_827 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_827  superoxide dismutase  100 
 
 		 192 aa  397  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0145605  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0956  superoxide dismutase  86.39 
 
 		 192 aa  358  4e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0840  manganese and iron superoxide dismutase  84.74 
 
 		 192 aa  351  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00121294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1158  superoxide dismutase  64.74 
 
 		 192 aa  274  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000413259  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1453  manganese and iron superoxide dismutase  65.79 
 
 		 192 aa  270  9e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.46198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2410  manganese and iron superoxide dismutase  63.16 
 
 		 192 aa  270  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000430969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2204  manganese and iron superoxide dismutase  59.47 
 
 		 194 aa  257  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000605082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2022  manganese and iron superoxide dismutase  58.95 
 
 		 194 aa  254  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000363607 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1904  manganese and iron superoxide dismutase  47.42 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338856 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2012  manganese and iron superoxide dismutase  47.94 
 
 		 201 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1952  manganese and iron superoxide dismutase  47.94 
 
 		 201 aa  185  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.777519  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1927  manganese and iron superoxide dismutase  47.94 
 
 		 201 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.241942  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1898  superoxide dismutase  42.19 
 
 		 205 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1574  manganese and iron superoxide dismutase  42.19 
 
 		 205 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  39.46 
 
 		 305 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6201  manganese and iron superoxide dismutase  37.84 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555386 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1781  manganese and iron superoxide dismutase  33.33 
 
 		 239 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2101  manganese and iron superoxide dismutase  32.79 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2529  manganese and iron superoxide dismutase  35.71 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.507658  normal  0.528937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2537  manganese and iron superoxide dismutase  35.16 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4364  manganese and iron superoxide dismutase  33.7 
 
 		 203 aa  101  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0235641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1258  Superoxide dismutase  35.75 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.651957  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  35.98 
 
 		 302 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  35.33 
 
 		 308 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2234  manganese and iron superoxide dismutase  33.88 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7990  manganese and iron superoxide dismutase  33.88 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0509196  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0075  Superoxide dismutase  33.7 
 
 		 207 aa  95.1  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  35.43 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6159  manganese and iron superoxide dismutase  33.33 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1292  Superoxide dismutase  33.73 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  32.18 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  29.48 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  30.51 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  29.48 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  29.48 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1889  superoxide dismutase  31.55 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.61793 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  31.18 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0214  superoxide dismutase  31.14 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  33.33 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  29.02 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  30.59 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  33.08 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  30 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  30 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  32.33 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  30.77 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  31.43 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  29.21 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  28.9 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  29.89 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  30.23 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  29.78 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  28.32 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  29.82 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  29.07 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  29.59 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  29.63 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  28.89 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  29.01 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  30.77 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  29.45 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  28.57 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  28.07 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  30.18 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  27.51 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  28.07 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  27.95 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  28.18 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  30.99 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  30.16 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  26.29 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  28.73 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  29.85 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  32.75 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  26.44 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  28.81 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  27.27 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  32.93 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  32.93 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  30.08 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  31.95 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  29.55 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  29.55 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  29.55 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  26.67 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  25.95 
 
 		 304 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  29.67 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  26.67 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1628  Superoxide dismutase  29.51 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  29.07 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0882  superoxide dismutase  33.33 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  25.95 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0464  superoxide dismutase, manganese  31.44 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000102594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  26.46 
 
 		 304 aa  67  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  26.11 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  26.7 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  26.46 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  26.46 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  26.46 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  26.6 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>