More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2537 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2537  manganese and iron superoxide dismutase  100 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011887  Mnod_7990  manganese and iron superoxide dismutase  63.73 
 
 		 205 aa  254  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0509196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2234  manganese and iron superoxide dismutase  64.58 
 
 		 205 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2529  manganese and iron superoxide dismutase  63.35 
 
 		 197 aa  251  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.507658  normal  0.528937 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6201  manganese and iron superoxide dismutase  64.21 
 
 		 197 aa  241  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6159  manganese and iron superoxide dismutase  61.66 
 
 		 204 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  63.54 
 
 		 302 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  60.77 
 
 		 305 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  62.16 
 
 		 308 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1781  manganese and iron superoxide dismutase  47.85 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4364  manganese and iron superoxide dismutase  43.39 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0235641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2022  manganese and iron superoxide dismutase  36.26 
 
 		 194 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000363607 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2204  manganese and iron superoxide dismutase  36.26 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0840  manganese and iron superoxide dismutase  35.16 
 
 		 192 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00121294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0956  superoxide dismutase  34.07 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_827  superoxide dismutase  35.16 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0145605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1453  manganese and iron superoxide dismutase  34.08 
 
 		 192 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.46198  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU1158  superoxide dismutase  37.7 
 
 		 192 aa  95.5  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000413259  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0075  Superoxide dismutase  30.53 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2410  manganese and iron superoxide dismutase  36.11 
 
 		 192 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000430969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  33.68 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1258  Superoxide dismutase  32.62 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.651957  n/a   
 
 
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NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  33.16 
 
 		 199 aa  89  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  32.64 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  33.84 
 
 		 200 aa  85.5  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  32.31 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2101  manganese and iron superoxide dismutase  31.61 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  29.17 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
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NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  33.87 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
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NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  33.68 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  36.92 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
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NC_010577  XfasM23_0923  superoxide dismutase  29.71 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.790701  n/a   
 
 
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NC_010513  Xfasm12_1046  superoxide dismutase  29.29 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675298  n/a   
 
 
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NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  34.29 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  34.29 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  32.43 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  32.82 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
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NC_013037  Dfer_4203  Superoxide dismutase  33.33 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  32.16 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  33.88 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE0164  superoxide dismutase, Fe  29.8 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  28.12 
 
 		 348 aa  79  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
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NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  31.69 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0205  superoxide dismutase, Fe  29.8 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.570423  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  31.12 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_1952  manganese and iron superoxide dismutase  32.84 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.777519  n/a   
 
 
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NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  29 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  27.37 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  33 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  33.33 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_1927  manganese and iron superoxide dismutase  32.84 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.241942  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  31.12 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  31.72 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2012  manganese and iron superoxide dismutase  32.84 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  27.37 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
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NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  35.57 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  27.13 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  33.85 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  33.5 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_1446  Mn/Fe superoxide dismutase  26.21 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.769471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  27.37 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1251  Mn/Fe superoxide dismutase  26.21 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.275789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  33.5 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  27.89 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  27.89 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  27.89 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  27.89 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  27.89 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  27.89 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1601  Superoxide dismutase  31.97 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  27.89 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1897  Superoxide dismutase  29.82 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  31.98 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  33.68 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  30.3 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0184  superoxide dismutase, Fe  29 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0050  superoxide dismutase (Fe)  29.59 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.408378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  33.33 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  34.74 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  27.6 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  29.47 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  31.41 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  32.45 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2494  Superoxide dismutase  30.88 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  24.77 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  24.77 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  30.26 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  30.05 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0882  superoxide dismutase  31.22 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343803  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1320  Superoxide dismutase  29.81 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  27.14 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  29.76 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.331082 
 
 
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NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  31.11 
 
 		 209 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  32.8 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  26.56 
 
 		 304 aa  72  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_1986  Superoxide dismutase  32.1 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_0814  Superoxide dismutase  30.41 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.486373 
 
 
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NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  25.51 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
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NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  29.47 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  31.28 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
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