More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0616 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  100 
 
 
204 aa  423  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  80.39 
 
 
204 aa  351  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  72.77 
 
 
207 aa  310  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  71.78 
 
 
209 aa  306  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  72.31 
 
 
208 aa  304  7e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  72.5 
 
 
208 aa  303  8.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  72.5 
 
 
226 aa  303  9.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  71.36 
 
 
200 aa  303  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  68.81 
 
 
209 aa  300  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  68.81 
 
 
209 aa  299  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  71.07 
 
 
207 aa  298  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  68.45 
 
 
207 aa  296  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  68.45 
 
 
207 aa  296  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  68.45 
 
 
207 aa  296  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  70.97 
 
 
209 aa  288  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  67.17 
 
 
203 aa  288  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  67.18 
 
 
206 aa  288  4e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  67.51 
 
 
207 aa  284  5.999999999999999e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  67.82 
 
 
207 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  64.97 
 
 
203 aa  282  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  61.31 
 
 
299 aa  276  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  64.65 
 
 
209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  59.3 
 
 
202 aa  273  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  65.05 
 
 
207 aa  270  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  62.5 
 
 
207 aa  268  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  59.49 
 
 
200 aa  266  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  58.42 
 
 
209 aa  252  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  49.21 
 
 
269 aa  217  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  51.01 
 
 
304 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  48.99 
 
 
348 aa  211  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  51.52 
 
 
437 aa  210  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  50.26 
 
 
198 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  50 
 
 
304 aa  208  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  50 
 
 
304 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  50 
 
 
304 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  50.51 
 
 
304 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  50.51 
 
 
304 aa  208  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  50.51 
 
 
304 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  50.51 
 
 
304 aa  208  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  50.51 
 
 
304 aa  208  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  50.51 
 
 
304 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  50.51 
 
 
304 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  46.39 
 
 
198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  46.11 
 
 
195 aa  191  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  44.85 
 
 
197 aa  190  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  49.74 
 
 
208 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654042 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  47.15 
 
 
223 aa  184  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31067  Mn-Superoxide dismutase  44.56 
 
 
224 aa  184  9e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.076255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  44.85 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  46.84 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  46.08 
 
 
205 aa  180  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  44.83 
 
 
225 aa  179  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  45.18 
 
 
208 aa  179  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0762  superoxide dismutase (Mn)  48.24 
 
 
201 aa  177  8e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0276674  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  41.87 
 
 
206 aa  175  4e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  43.75 
 
 
223 aa  174  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  44.78 
 
 
203 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00785  mitochondrial superoxide dismutase (Eurofung)  45.1 
 
 
213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.852927 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  42.19 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  45.77 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63831  manganese-superoxide dismutase  47.24 
 
 
208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0567  superoxide dismutase  44.39 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  45.77 
 
 
204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  42.93 
 
 
211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  44.06 
 
 
211 aa  171  5e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  40.91 
 
 
203 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34151  manganese-superoxide dismutase  47.21 
 
 
227 aa  170  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.096588  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  45.27 
 
 
203 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  43.63 
 
 
203 aa  169  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1705  superoxide dismutase  45.41 
 
 
205 aa  168  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  42.79 
 
 
209 aa  168  6e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  44.78 
 
 
241 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  43.56 
 
 
204 aa  167  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  44.44 
 
 
204 aa  167  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  43.27 
 
 
212 aa  167  9e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  43.07 
 
 
211 aa  167  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  44.72 
 
 
205 aa  167  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  44.28 
 
 
210 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  43.78 
 
 
203 aa  166  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  42.86 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  41.67 
 
 
203 aa  165  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  42.03 
 
 
261 aa  165  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  42.5 
 
 
203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  42.08 
 
 
203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  43.5 
 
 
204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  40.8 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  43.65 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0729  superoxide dismutase  40.2 
 
 
207 aa  162  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0072  Superoxide dismutase  45.15 
 
 
208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  39.51 
 
 
270 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  44.62 
 
 
200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  43 
 
 
203 aa  161  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  43.28 
 
 
209 aa  161  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  46 
 
 
201 aa  161  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  41.79 
 
 
203 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  41.67 
 
 
203 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42832  mutase superoxide dismutase  39.8 
 
 
226 aa  160  9e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2282  Superoxide dismutase  43.96 
 
 
209 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455124  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0607  superoxide dismutase  41.63 
 
 
244 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.996807  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  41.29 
 
 
206 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>