More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2155 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  100 
 
 
200 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1103  superoxide dismutase  71.21 
 
 
202 aa  304  6e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.780298  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1748  Superoxide dismutase  61.69 
 
 
202 aa  277  7e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5395  Superoxide dismutase  63.82 
 
 
204 aa  276  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  61.5 
 
 
201 aa  275  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  61.31 
 
 
209 aa  275  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0237  superoxide dismutase  62.69 
 
 
203 aa  274  5e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000011486  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4203  Superoxide dismutase  59 
 
 
201 aa  267  7e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  61.31 
 
 
203 aa  265  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  58.21 
 
 
201 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2906  Superoxide dismutase  59.09 
 
 
240 aa  261  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  59.41 
 
 
204 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  59.41 
 
 
204 aa  258  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2266  superoxide dismutase, Mn  56.85 
 
 
222 aa  257  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000301489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1601  Superoxide dismutase  58.59 
 
 
231 aa  253  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  57.49 
 
 
212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1046  superoxide dismutase  59 
 
 
246 aa  248  5e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675298  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  58.08 
 
 
201 aa  247  7e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0923  superoxide dismutase  58.5 
 
 
246 aa  246  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.790701  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00151  manganese superoxide dismutase  55.84 
 
 
202 aa  246  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0230  hypothetical protein  55.45 
 
 
205 aa  247  1e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.823179 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002217  manganese superoxide dismutase  55.84 
 
 
202 aa  246  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.378947  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  55.61 
 
 
203 aa  246  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2494  Superoxide dismutase  56.8 
 
 
204 aa  244  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  56.86 
 
 
204 aa  244  4.9999999999999997e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  58.13 
 
 
204 aa  243  9e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  56.86 
 
 
201 aa  243  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  56.04 
 
 
209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  55.22 
 
 
203 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  54.68 
 
 
203 aa  241  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  54.68 
 
 
203 aa  241  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  54.68 
 
 
203 aa  241  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  54.68 
 
 
203 aa  241  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  54.68 
 
 
203 aa  241  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  54.68 
 
 
203 aa  241  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  54.68 
 
 
203 aa  241  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  54.68 
 
 
203 aa  241  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  54.68 
 
 
203 aa  241  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0704  superoxide dismutase  57.21 
 
 
200 aa  241  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  55.56 
 
 
202 aa  239  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  58.42 
 
 
204 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  56.1 
 
 
203 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  57.07 
 
 
203 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  54.41 
 
 
199 aa  238  4e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  57.77 
 
 
211 aa  236  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  54.63 
 
 
204 aa  236  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  56.1 
 
 
203 aa  236  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  53.69 
 
 
203 aa  235  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1897  Superoxide dismutase  53.96 
 
 
232 aa  235  3e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2669  Superoxide dismutase  54.15 
 
 
203 aa  235  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.804084  normal  0.155291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3237  superoxide dismutase  55.61 
 
 
201 aa  234  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3725  superoxide dismutase  55.88 
 
 
201 aa  234  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  hitchhiker  0.00168961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  56.44 
 
 
203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  55.94 
 
 
203 aa  232  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  54.37 
 
 
205 aa  231  6e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  54.41 
 
 
203 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3260  superoxide dismutase  55.94 
 
 
203 aa  231  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  55.45 
 
 
262 aa  231  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  55.45 
 
 
262 aa  231  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  53.66 
 
 
203 aa  229  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  56.8 
 
 
203 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0814  Superoxide dismutase  54.36 
 
 
246 aa  229  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.486373 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  51.72 
 
 
270 aa  228  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1611  superoxide dismutase  51.96 
 
 
199 aa  228  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.308425  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1645  superoxide dismutase  51.96 
 
 
199 aa  228  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159138  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4459  superoxide dismutase, Mn  57.07 
 
 
203 aa  227  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  55.45 
 
 
241 aa  227  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0749  superoxide dismutase  54.5 
 
 
240 aa  226  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3014  Superoxide dismutase  53.69 
 
 
268 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  55.45 
 
 
210 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  54.95 
 
 
203 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1320  Superoxide dismutase  55 
 
 
246 aa  224  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00022  superoxide dismutase  54.73 
 
 
235 aa  223  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00410451  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1628  Superoxide dismutase  54.23 
 
 
201 aa  222  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5571  superoxide dismutase, Mn  51.24 
 
 
208 aa  221  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5300  superoxide dismutase, Mn  51.24 
 
 
208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5142  superoxide dismutase, manganese  51.24 
 
 
208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0516387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5696  superoxide dismutase, Mn  51.24 
 
 
208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5239  superoxide dismutase  51.24 
 
 
208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5541  superoxide dismutase, Mn  51.24 
 
 
208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5378  superoxide dismutase, Mn  51.24 
 
 
208 aa  221  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000859451  normal  0.033463 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5579  superoxide dismutase, Mn  51.24 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2152  Superoxide dismutase  53.66 
 
 
201 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0622589 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5627  superoxide dismutase, Mn  51.24 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5127  superoxide dismutase, manganese  50.75 
 
 
208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0124  superoxide dismutase  50.98 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00649836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0119  superoxide dismutase  50.98 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000118363  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3962  superoxide dismutase  50.75 
 
 
208 aa  219  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  52 
 
 
193 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  52 
 
 
193 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  52.22 
 
 
261 aa  215  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0762  superoxide dismutase (Mn)  51.98 
 
 
201 aa  215  2.9999999999999998e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0276674  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4063  superoxide dismutase  52.43 
 
 
206 aa  215  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03794  superoxide dismutase, Mn  51.94 
 
 
206 aa  214  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5362  superoxide dismutase  51.94 
 
 
206 aa  214  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376376  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4387  superoxide dismutase  51.94 
 
 
206 aa  214  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4440  superoxide dismutase  51.94 
 
 
206 aa  214  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03743  hypothetical protein  51.94 
 
 
206 aa  214  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_2282  Superoxide dismutase  53.92 
 
 
209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455124  normal 
 
 
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NC_012880  Dd703_0072  Superoxide dismutase  53.17 
 
 
208 aa  214  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
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