More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15670 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  85.02 
 
 		 206 aa  367  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  86.96 
 
 		 209 aa  359  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  78.26 
 
 		 207 aa  343  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  74.4 
 
 		 209 aa  329  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  71.01 
 
 		 207 aa  320  7e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  68.12 
 
 		 207 aa  302  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  64.73 
 
 		 209 aa  291  6e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  64.73 
 
 		 209 aa  288  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  64.73 
 
 		 208 aa  285  2.9999999999999996e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  61.65 
 
 		 207 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  61.65 
 
 		 207 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  61.65 
 
 		 207 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  65.38 
 
 		 209 aa  280  8.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  66.33 
 
 		 200 aa  278  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  64.36 
 
 		 204 aa  278  5e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  61.65 
 
 		 208 aa  277  8e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  62.56 
 
 		 226 aa  276  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  62.94 
 
 		 204 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  59.51 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  59.6 
 
 		 203 aa  254  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  55.56 
 
 		 299 aa  251  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  59.6 
 
 		 203 aa  250  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  56.28 
 
 		 200 aa  239  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  55.38 
 
 		 202 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  54.37 
 
 		 207 aa  238  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  50.24 
 
 		 209 aa  226  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  53.09 
 
 		 198 aa  215  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  50 
 
 		 269 aa  215  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  51.03 
 
 		 198 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  47.69 
 
 		 348 aa  205  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  49.23 
 
 		 197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  46.43 
 
 		 437 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  45.55 
 
 		 195 aa  191  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  44.66 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  51.32 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 304 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 304 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  50.52 
 
 		 199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  46.15 
 
 		 304 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  46.15 
 
 		 304 aa  187  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  46.15 
 
 		 304 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  46.15 
 
 		 304 aa  187  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  46.15 
 
 		 304 aa  187  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  46.15 
 
 		 304 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  46.15 
 
 		 304 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  48.13 
 
 		 212 aa  187  9e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  44.1 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  49.51 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  50.25 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  47.94 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  42.93 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  48.53 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  48.48 
 
 		 206 aa  181  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  47.64 
 
 		 208 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  45.13 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  46.27 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31067  Mn-Superoxide dismutase  44.56 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.076255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  48.29 
 
 		 203 aa  178  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  47.45 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  47.32 
 
 		 203 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  46.91 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  47.32 
 
 		 203 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  47.32 
 
 		 203 aa  177  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  47.32 
 
 		 203 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  47.32 
 
 		 203 aa  177  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  47.32 
 
 		 203 aa  177  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  47.32 
 
 		 203 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  47.32 
 
 		 203 aa  177  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  47.32 
 
 		 203 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  47.45 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  47.69 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  47.76 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  43.63 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  48.02 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  46.31 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  47.98 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  46.83 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  47.47 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34151  manganese-superoxide dismutase  44.85 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.096588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  44.55 
 
 		 203 aa  171  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  47 
 
 		 203 aa  171  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  48.97 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3237  superoxide dismutase  46.15 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  46.94 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3725  superoxide dismutase  45.67 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  hitchhiker  0.00168961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  45.37 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4160  superoxide dismutase  50.24 
 
 		 208 aa  168  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1103  superoxide dismutase  46.12 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.780298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0749  superoxide dismutase  46.19 
 
 		 240 aa  168  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  43.37 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  45.27 
 
 		 202 aa  167  8e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  45.67 
 
 		 204 aa  167  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  45.59 
 
 		 270 aa  167  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  46.43 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  46.04 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  46.67 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63831  manganese-superoxide dismutase  45.45 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>