More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1059 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



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Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  100 
 
 
197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  73.2 
 
 
198 aa  301  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  72.68 
 
 
198 aa  301  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  69.63 
 
 
199 aa  269  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  58.76 
 
 
348 aa  261  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  58.76 
 
 
437 aa  254  8e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  56.7 
 
 
304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  56.19 
 
 
304 aa  252  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  56.7 
 
 
304 aa  251  7e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  56.7 
 
 
304 aa  251  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  56.7 
 
 
304 aa  251  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  56.7 
 
 
304 aa  251  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  56.7 
 
 
304 aa  251  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  56.7 
 
 
304 aa  251  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  56.7 
 
 
304 aa  251  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  55.67 
 
 
304 aa  251  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  58.76 
 
 
226 aa  249  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  54.64 
 
 
304 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  53.3 
 
 
223 aa  234  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  55.73 
 
 
195 aa  231  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  52.6 
 
 
223 aa  223  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  54.59 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  47.4 
 
 
269 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  48.72 
 
 
206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  47.03 
 
 
206 aa  195  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  47.42 
 
 
208 aa  193  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  46.91 
 
 
202 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  50.81 
 
 
209 aa  192  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  46.91 
 
 
226 aa  192  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  47.94 
 
 
204 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  49.73 
 
 
207 aa  190  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  44.85 
 
 
204 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  50.78 
 
 
214 aa  188  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  46.39 
 
 
208 aa  188  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  45.05 
 
 
203 aa  188  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  46.94 
 
 
203 aa  187  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  47.69 
 
 
207 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  45.88 
 
 
209 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  47.42 
 
 
299 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  46.67 
 
 
207 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  49.23 
 
 
207 aa  184  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  44.33 
 
 
209 aa  184  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  46.88 
 
 
203 aa  184  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  49.49 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  44.33 
 
 
209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  45.36 
 
 
207 aa  181  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  46.67 
 
 
200 aa  181  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  45.36 
 
 
207 aa  181  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  45.36 
 
 
207 aa  181  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0749  superoxide dismutase  42.79 
 
 
240 aa  177  8e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  47.47 
 
 
208 aa  177  8e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  43.59 
 
 
209 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  43.88 
 
 
200 aa  176  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  43.78 
 
 
204 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  45.88 
 
 
207 aa  176  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0729  superoxide dismutase  41.21 
 
 
207 aa  176  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  46.43 
 
 
200 aa  175  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  46.94 
 
 
200 aa  175  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  42.13 
 
 
241 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  43.5 
 
 
209 aa  174  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  44.72 
 
 
204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  49.49 
 
 
211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  44.16 
 
 
204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  39.9 
 
 
225 aa  171  5e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  49.49 
 
 
211 aa  171  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  41.41 
 
 
262 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  47.18 
 
 
208 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  41.41 
 
 
262 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  43.23 
 
 
209 aa  169  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  41.21 
 
 
270 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  45.31 
 
 
203 aa  169  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  40.51 
 
 
207 aa  168  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  49.49 
 
 
211 aa  168  5e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  43.22 
 
 
204 aa  167  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2494  Superoxide dismutase  44.72 
 
 
204 aa  167  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  44.28 
 
 
203 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  47.03 
 
 
203 aa  166  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4533  superoxide dismutase  40.59 
 
 
254 aa  165  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.0274714 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  44.85 
 
 
200 aa  165  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  44.39 
 
 
203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  41.79 
 
 
203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  45.69 
 
 
206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  43.81 
 
 
205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3237  superoxide dismutase  41.87 
 
 
201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  41.79 
 
 
203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  41.79 
 
 
203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  41.79 
 
 
203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  41.79 
 
 
203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  41.79 
 
 
203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  42.29 
 
 
203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  41.79 
 
 
203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  41.79 
 
 
203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  42.86 
 
 
205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  41.79 
 
 
203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  42.71 
 
 
201 aa  162  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  40.93 
 
 
203 aa  161  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
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NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  42 
 
 
204 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  42.29 
 
 
203 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009051  Memar_1705  superoxide dismutase  44.39 
 
 
205 aa  160  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_3014  Superoxide dismutase  40.7 
 
 
268 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
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