More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0830 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  100 
 
 		 212 aa  441  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4385  superoxide dismutase  73.21 
 
 		 206 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0287129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4301  superoxide dismutase  73.21 
 
 		 206 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4453  superoxide dismutase  73.21 
 
 		 206 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4341  superoxide dismutase  73.21 
 
 		 206 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000961224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4272  superoxide dismutase  72.73 
 
 		 206 aa  310  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.309361  normal  0.820787 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03794  superoxide dismutase, Mn  72.25 
 
 		 206 aa  310  9e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4387  superoxide dismutase  72.25 
 
 		 206 aa  310  9e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03743  hypothetical protein  72.25 
 
 		 206 aa  310  9e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5362  superoxide dismutase  72.25 
 
 		 206 aa  310  9e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4440  superoxide dismutase  72.25 
 
 		 206 aa  310  9e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4109  superoxide dismutase  71.77 
 
 		 206 aa  310  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4076  Superoxide dismutase  71.77 
 
 		 206 aa  310  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4138  superoxide dismutase  71.77 
 
 		 206 aa  310  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4300  superoxide dismutase  71.77 
 
 		 206 aa  309  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.928831  hitchhiker  0.00748774 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0072  Superoxide dismutase  69.71 
 
 		 208 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4063  superoxide dismutase  70.33 
 
 		 206 aa  304  5.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0056  Superoxide dismutase  70.33 
 
 		 208 aa  304  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0035  superoxide dismutase  67.94 
 
 		 207 aa  304  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4121  superoxide dismutase  67.94 
 
 		 207 aa  304  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3773  superoxide dismutase  67.94 
 
 		 207 aa  304  7e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4160  superoxide dismutase  68.9 
 
 		 208 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4442  superoxide dismutase  67.94 
 
 		 208 aa  297  7e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0081  superoxide dismutase  67.92 
 
 		 206 aa  295  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  65.7 
 
 		 203 aa  292  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  63.98 
 
 		 204 aa  290  9e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  64.76 
 
 		 204 aa  287  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2669  Superoxide dismutase  64.25 
 
 		 203 aa  286  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.804084  normal  0.155291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  61.61 
 
 		 204 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  63.77 
 
 		 203 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  63.77 
 
 		 203 aa  279  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  62.2 
 
 		 203 aa  276  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3260  superoxide dismutase  61.72 
 
 		 203 aa  276  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  61.14 
 
 		 209 aa  276  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  61.43 
 
 		 204 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  63.94 
 
 		 205 aa  275  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  61.84 
 
 		 203 aa  275  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2282  Superoxide dismutase  60.48 
 
 		 209 aa  274  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  62.5 
 
 		 203 aa  274  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0464  superoxide dismutase, manganese  63.21 
 
 		 209 aa  274  8e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000102594  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  62.2 
 
 		 203 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  61.35 
 
 		 241 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  61.84 
 
 		 203 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  61.84 
 
 		 203 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  61.84 
 
 		 203 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  61.84 
 
 		 203 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  61.84 
 
 		 203 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  61.84 
 
 		 203 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  61.84 
 
 		 203 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  61.84 
 
 		 203 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  61.84 
 
 		 203 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  61.84 
 
 		 203 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  62.5 
 
 		 204 aa  272  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  61.54 
 
 		 201 aa  272  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  61.35 
 
 		 210 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  60.87 
 
 		 203 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  62.32 
 
 		 201 aa  271  7e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0483  manganese superoxide dismutase  62.68 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.286987  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  63.16 
 
 		 211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  61.35 
 
 		 203 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  60.1 
 
 		 203 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  58.65 
 
 		 202 aa  266  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4586  superoxide dismutase  61.61 
 
 		 211 aa  267  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  62.5 
 
 		 201 aa  266  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0749  superoxide dismutase  58.42 
 
 		 240 aa  265  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  61.17 
 
 		 201 aa  265  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4459  superoxide dismutase, Mn  61.35 
 
 		 203 aa  264  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2662  superoxide dismutase  63.03 
 
 		 210 aa  264  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00481875  normal  0.116987 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1103  superoxide dismutase  60.58 
 
 		 202 aa  263  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.780298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  63.11 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  56.04 
 
 		 204 aa  262  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  59.24 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1628  Superoxide dismutase  59.61 
 
 		 201 aa  258  6e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  57.77 
 
 		 203 aa  257  9e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  56.25 
 
 		 199 aa  255  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1748  Superoxide dismutase  56.73 
 
 		 202 aa  255  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5395  Superoxide dismutase  56.25 
 
 		 204 aa  254  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0237  superoxide dismutase  58.37 
 
 		 203 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000011486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0704  superoxide dismutase  58.91 
 
 		 200 aa  253  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  57.49 
 
 		 200 aa  253  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1645  superoxide dismutase  55.77 
 
 		 199 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159138  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1611  superoxide dismutase  55.77 
 
 		 199 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.308425  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  56.52 
 
 		 270 aa  251  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2152  Superoxide dismutase  56.52 
 
 		 201 aa  252  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0622589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3237  superoxide dismutase  57 
 
 		 201 aa  250  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0230  hypothetical protein  54.15 
 
 		 205 aa  249  2e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.823179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1320  Superoxide dismutase  58.05 
 
 		 246 aa  249  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4203  Superoxide dismutase  57.21 
 
 		 201 aa  248  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3725  superoxide dismutase  56.52 
 
 		 201 aa  247  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  hitchhiker  0.00168961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2906  Superoxide dismutase  58.71 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  55.98 
 
 		 203 aa  243  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0762  superoxide dismutase (Mn)  55.77 
 
 		 201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0276674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3014  Superoxide dismutase  55.83 
 
 		 268 aa  241  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2494  Superoxide dismutase  54.03 
 
 		 204 aa  238  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  52.68 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  52.68 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1601  Superoxide dismutase  53.47 
 
 		 231 aa  236  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1235  Superoxide dismutase  54.63 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  52.63 
 
 		 241 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0788  superoxide dismutase, Fe-Mn  56.46 
 
 		 202 aa  233  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.319685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>