More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0920 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  100 
 
 		 209 aa  433  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  75.12 
 
 		 204 aa  328  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  74.63 
 
 		 204 aa  323  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3237  superoxide dismutase  69.15 
 
 		 201 aa  305  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  68.97 
 
 		 204 aa  305  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  70.71 
 
 		 203 aa  304  7e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  68.97 
 
 		 204 aa  303  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0704  superoxide dismutase  68.5 
 
 		 200 aa  299  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3725  superoxide dismutase  68.16 
 
 		 201 aa  298  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  hitchhiker  0.00168961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2494  Superoxide dismutase  67.82 
 
 		 204 aa  298  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1628  Superoxide dismutase  69.54 
 
 		 201 aa  296  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  68.69 
 
 		 203 aa  295  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  68.18 
 
 		 203 aa  293  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  68.18 
 
 		 203 aa  293  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  68.18 
 
 		 203 aa  293  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  68.18 
 
 		 203 aa  293  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  68.18 
 
 		 203 aa  293  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  68.18 
 
 		 203 aa  293  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  65.37 
 
 		 205 aa  293  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  68.18 
 
 		 203 aa  293  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  68.18 
 
 		 203 aa  293  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  68.69 
 
 		 203 aa  292  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  66.34 
 
 		 203 aa  291  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  67.68 
 
 		 203 aa  291  6e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0749  superoxide dismutase  64.1 
 
 		 240 aa  287  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  64.4 
 
 		 270 aa  282  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  62 
 
 		 262 aa  281  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  62 
 
 		 262 aa  281  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  64.39 
 
 		 204 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2152  Superoxide dismutase  64.47 
 
 		 201 aa  280  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0622589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  61.76 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  61.14 
 
 		 212 aa  276  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  64.71 
 
 		 203 aa  275  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  61.69 
 
 		 261 aa  274  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  64.22 
 
 		 203 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  65.05 
 
 		 201 aa  271  7e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2669  Superoxide dismutase  61.76 
 
 		 203 aa  270  9e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.804084  normal  0.155291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4533  superoxide dismutase  58.91 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.0274714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  63.41 
 
 		 204 aa  269  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  62.25 
 
 		 203 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  64.04 
 
 		 203 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  63.55 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  62.56 
 
 		 203 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  63.55 
 
 		 210 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  63.29 
 
 		 211 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  63.59 
 
 		 201 aa  265  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3014  Superoxide dismutase  61.26 
 
 		 268 aa  264  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  60.29 
 
 		 203 aa  262  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  59.8 
 
 		 203 aa  260  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3359  Superoxide dismutase  59.71 
 
 		 207 aa  260  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000950604  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  60.8 
 
 		 199 aa  259  3e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3962  superoxide dismutase  58.91 
 
 		 208 aa  258  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5300  superoxide dismutase, Mn  57.92 
 
 		 208 aa  256  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5142  superoxide dismutase, manganese  57.92 
 
 		 208 aa  256  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0516387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5696  superoxide dismutase, Mn  57.92 
 
 		 208 aa  256  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5541  superoxide dismutase, Mn  57.92 
 
 		 208 aa  256  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4121  superoxide dismutase  58.17 
 
 		 207 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5239  superoxide dismutase  57.92 
 
 		 208 aa  256  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5579  superoxide dismutase, Mn  57.92 
 
 		 208 aa  256  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3773  superoxide dismutase  58.17 
 
 		 207 aa  256  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3260  superoxide dismutase  61.27 
 
 		 203 aa  256  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0035  superoxide dismutase  58.17 
 
 		 207 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5627  superoxide dismutase, Mn  57.92 
 
 		 208 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5127  superoxide dismutase, manganese  57.92 
 
 		 208 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  60 
 
 		 202 aa  255  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5571  superoxide dismutase, Mn  57.43 
 
 		 208 aa  255  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5378  superoxide dismutase, Mn  57.43 
 
 		 208 aa  255  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000859451  normal  0.033463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  61.39 
 
 		 203 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2282  Superoxide dismutase  58.29 
 
 		 209 aa  255  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1645  superoxide dismutase  59.8 
 
 		 199 aa  254  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159138  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1611  superoxide dismutase  59.8 
 
 		 199 aa  254  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.308425  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2662  superoxide dismutase  62.68 
 
 		 210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00481875  normal  0.116987 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4160  superoxide dismutase  58.65 
 
 		 208 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  61.76 
 
 		 209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4459  superoxide dismutase, Mn  61.76 
 
 		 203 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  58.91 
 
 		 206 aa  250  9.000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  58.82 
 
 		 203 aa  250  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5395  Superoxide dismutase  58.54 
 
 		 204 aa  249  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0762  superoxide dismutase (Mn)  58.42 
 
 		 201 aa  249  3e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0276674  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0237  superoxide dismutase  59.13 
 
 		 203 aa  248  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000011486  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4442  superoxide dismutase  58.05 
 
 		 208 aa  248  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0607  superoxide dismutase  54.95 
 
 		 244 aa  247  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.996807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  60.7 
 
 		 201 aa  247  8e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0072  Superoxide dismutase  58.65 
 
 		 208 aa  247  8e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4203  Superoxide dismutase  60.19 
 
 		 201 aa  247  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1748  Superoxide dismutase  56.8 
 
 		 202 aa  246  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4586  superoxide dismutase  58.29 
 
 		 211 aa  246  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0485  twin-arginine translocation pathway signal  54.95 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.7715  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0458  superoxide dismutase  61.46 
 
 		 206 aa  246  2e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1103  superoxide dismutase  57.77 
 
 		 202 aa  244  8e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.780298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2294  superoxide dismutase  58.62 
 
 		 255 aa  243  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2920  superoxide dismutase  60 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  56.04 
 
 		 200 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0081  superoxide dismutase  58.05 
 
 		 206 aa  242  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1897  Superoxide dismutase  55.07 
 
 		 232 aa  241  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03794  superoxide dismutase, Mn  58.05 
 
 		 206 aa  241  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4387  superoxide dismutase  58.05 
 
 		 206 aa  241  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03743  hypothetical protein  58.05 
 
 		 206 aa  241  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4063  superoxide dismutase  57.56 
 
 		 206 aa  241  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4440  superoxide dismutase  58.05 
 
 		 206 aa  241  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>