More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0035 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0035  superoxide dismutase  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3773  superoxide dismutase  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4121  superoxide dismutase  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4160  superoxide dismutase  89.37 
 
 		 208 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4442  superoxide dismutase  89.86 
 
 		 208 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0081  superoxide dismutase  89.86 
 
 		 206 aa  391  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0072  Superoxide dismutase  85.44 
 
 		 208 aa  377  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4063  superoxide dismutase  86.96 
 
 		 206 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03794  superoxide dismutase, Mn  85.02 
 
 		 206 aa  370  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4076  Superoxide dismutase  85.02 
 
 		 206 aa  370  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4385  superoxide dismutase  85.99 
 
 		 206 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0287129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4440  superoxide dismutase  85.02 
 
 		 206 aa  370  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4138  superoxide dismutase  85.02 
 
 		 206 aa  370  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4272  superoxide dismutase  85.51 
 
 		 206 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.309361  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4387  superoxide dismutase  85.02 
 
 		 206 aa  370  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4341  superoxide dismutase  85.99 
 
 		 206 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000961224 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4301  superoxide dismutase  85.99 
 
 		 206 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5362  superoxide dismutase  85.02 
 
 		 206 aa  370  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4453  superoxide dismutase  85.99 
 
 		 206 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4300  superoxide dismutase  85.51 
 
 		 206 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.928831  hitchhiker  0.00748774 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4109  superoxide dismutase  85.02 
 
 		 206 aa  370  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03743  hypothetical protein  85.02 
 
 		 206 aa  370  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0056  Superoxide dismutase  83.09 
 
 		 208 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0464  superoxide dismutase, manganese  75.12 
 
 		 209 aa  327  9e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000102594  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  67.94 
 
 		 212 aa  304  7e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0483  manganese superoxide dismutase  66.18 
 
 		 207 aa  299  2e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.286987  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4586  superoxide dismutase  63.46 
 
 		 211 aa  273  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  63.94 
 
 		 205 aa  271  7e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2282  Superoxide dismutase  62.02 
 
 		 209 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  60.29 
 
 		 204 aa  261  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  60.87 
 
 		 203 aa  260  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  61.84 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  60.87 
 
 		 203 aa  258  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  60.87 
 
 		 203 aa  258  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  60.87 
 
 		 203 aa  258  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  58.37 
 
 		 204 aa  258  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  60.87 
 
 		 203 aa  258  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  60.87 
 
 		 203 aa  258  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  60.87 
 
 		 203 aa  258  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  60.87 
 
 		 203 aa  258  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  60.87 
 
 		 203 aa  258  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  58.17 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  60.19 
 
 		 211 aa  254  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  59.9 
 
 		 203 aa  252  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2662  superoxide dismutase  58.02 
 
 		 210 aa  250  8.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00481875  normal  0.116987 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0749  superoxide dismutase  55.56 
 
 		 240 aa  249  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  60.1 
 
 		 201 aa  248  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  59.62 
 
 		 204 aa  248  6e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3260  superoxide dismutase  58.17 
 
 		 203 aa  246  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  56.31 
 
 		 203 aa  245  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  55.61 
 
 		 204 aa  245  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2669  Superoxide dismutase  57.21 
 
 		 203 aa  245  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.804084  normal  0.155291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  57.69 
 
 		 203 aa  244  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0704  superoxide dismutase  57.92 
 
 		 200 aa  243  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  58.17 
 
 		 204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1628  Superoxide dismutase  58.94 
 
 		 201 aa  242  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  56.25 
 
 		 203 aa  241  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4459  superoxide dismutase, Mn  56.73 
 
 		 203 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  57.21 
 
 		 203 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  55.77 
 
 		 203 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  56.73 
 
 		 204 aa  238  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  54.37 
 
 		 261 aa  237  8e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1897  Superoxide dismutase  55.61 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  57.62 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  58.65 
 
 		 201 aa  234  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  55.02 
 
 		 203 aa  234  9e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  55.98 
 
 		 203 aa  233  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  53.14 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  55.24 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2152  Superoxide dismutase  54.68 
 
 		 201 aa  231  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0622589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3237  superoxide dismutase  53.62 
 
 		 201 aa  231  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5395  Superoxide dismutase  53.11 
 
 		 204 aa  230  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1611  superoxide dismutase  53.14 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.308425  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1645  superoxide dismutase  53.14 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159138  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  54.81 
 
 		 203 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1103  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 202 aa  227  9e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.780298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 241 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 210 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0762  superoxide dismutase (Mn)  52.4 
 
 		 201 aa  224  6e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0276674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3725  superoxide dismutase  52.66 
 
 		 201 aa  224  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  hitchhiker  0.00168961 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  54.19 
 
 		 201 aa  224  9e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  52.88 
 
 		 203 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2494  Superoxide dismutase  50.24 
 
 		 204 aa  223  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  52.4 
 
 		 203 aa  223  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  51.92 
 
 		 203 aa  221  4e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4203  Superoxide dismutase  53.59 
 
 		 201 aa  221  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  50.98 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  48.53 
 
 		 262 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  48.53 
 
 		 262 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0458  superoxide dismutase  54.25 
 
 		 206 aa  219  3e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0237  superoxide dismutase  54.5 
 
 		 203 aa  218  5e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000011486  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  49.76 
 
 		 202 aa  218  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3359  Superoxide dismutase  52.24 
 
 		 207 aa  218  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000950604  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0119  superoxide dismutase  51.69 
 
 		 199 aa  216  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000118363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0607  superoxide dismutase  50.24 
 
 		 244 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.996807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0124  superoxide dismutase  51.69 
 
 		 199 aa  216  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00649836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4533  superoxide dismutase  47.57 
 
 		 254 aa  216  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.0274714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0485  twin-arginine translocation pathway signal  48.54 
 
 		 244 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.7715  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2906  Superoxide dismutase  55.45 
 
 		 240 aa  213  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  48.31 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>