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for query gene Sdel_1897 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1897  Superoxide dismutase  100 
 
 
232 aa  480  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00022  superoxide dismutase  62.69 
 
 
235 aa  279  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00410451  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0923  superoxide dismutase  62.07 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.790701  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1046  superoxide dismutase  62.07 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675298  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  63.37 
 
 
201 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  62.87 
 
 
201 aa  262  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  58.71 
 
 
209 aa  256  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5395  Superoxide dismutase  58.29 
 
 
204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4203  Superoxide dismutase  58.42 
 
 
201 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4160  superoxide dismutase  57.14 
 
 
208 aa  244  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  59.5 
 
 
203 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4442  superoxide dismutase  56.67 
 
 
208 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  55.07 
 
 
209 aa  241  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0237  superoxide dismutase  56.93 
 
 
203 aa  241  9e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000011486  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  53.88 
 
 
241 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0072  Superoxide dismutase  55.71 
 
 
208 aa  239  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2906  Superoxide dismutase  60.31 
 
 
240 aa  239  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1320  Superoxide dismutase  57.84 
 
 
246 aa  239  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1748  Superoxide dismutase  56.93 
 
 
202 aa  239  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  48.87 
 
 
262 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  48.87 
 
 
262 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0081  superoxide dismutase  58.45 
 
 
206 aa  237  9e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3237  superoxide dismutase  54.41 
 
 
201 aa  237  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3773  superoxide dismutase  55.61 
 
 
207 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0035  superoxide dismutase  55.61 
 
 
207 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  54.85 
 
 
203 aa  236  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4121  superoxide dismutase  55.61 
 
 
207 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  53.96 
 
 
200 aa  235  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  53.4 
 
 
203 aa  234  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  55.5 
 
 
201 aa  234  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0056  Superoxide dismutase  54.29 
 
 
208 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4533  superoxide dismutase  50.96 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.0274714 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4385  superoxide dismutase  55.07 
 
 
206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0287129  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4301  superoxide dismutase  55.07 
 
 
206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  55.34 
 
 
204 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4341  superoxide dismutase  55.07 
 
 
206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000961224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0704  superoxide dismutase  55.28 
 
 
200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4453  superoxide dismutase  55.07 
 
 
206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03794  superoxide dismutase, Mn  54.59 
 
 
206 aa  232  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5362  superoxide dismutase  54.59 
 
 
206 aa  232  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376376  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03743  hypothetical protein  54.59 
 
 
206 aa  232  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  47.93 
 
 
270 aa  232  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4387  superoxide dismutase  54.59 
 
 
206 aa  232  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4440  superoxide dismutase  54.59 
 
 
206 aa  232  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4076  Superoxide dismutase  54.11 
 
 
206 aa  231  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4109  superoxide dismutase  54.11 
 
 
206 aa  231  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4138  superoxide dismutase  54.11 
 
 
206 aa  231  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4063  superoxide dismutase  55.07 
 
 
206 aa  231  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1103  superoxide dismutase  53.96 
 
 
202 aa  231  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.780298  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4272  superoxide dismutase  54.59 
 
 
206 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.309361  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4300  superoxide dismutase  54.11 
 
 
206 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.928831  hitchhiker  0.00748774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  55.07 
 
 
211 aa  229  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  53.66 
 
 
204 aa  228  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  51.44 
 
 
204 aa  228  7e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0749  superoxide dismutase  53.43 
 
 
240 aa  228  7e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  52.68 
 
 
205 aa  227  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3359  Superoxide dismutase  50.49 
 
 
207 aa  227  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000950604  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2494  Superoxide dismutase  52.91 
 
 
204 aa  226  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3725  superoxide dismutase  53.69 
 
 
201 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  hitchhiker  0.00168961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0485  twin-arginine translocation pathway signal  53.17 
 
 
244 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.7715  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  54.9 
 
 
203 aa  225  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  54.59 
 
 
203 aa  225  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0230  hypothetical protein  50.24 
 
 
205 aa  224  8e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.823179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  54.41 
 
 
203 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  54.41 
 
 
203 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  54.41 
 
 
203 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  54.41 
 
 
203 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  52.2 
 
 
204 aa  223  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  54.41 
 
 
203 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  54.41 
 
 
203 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  54.41 
 
 
203 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  51.69 
 
 
203 aa  223  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  54.41 
 
 
203 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0607  superoxide dismutase  52.2 
 
 
244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.996807  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  54.68 
 
 
203 aa  221  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  51.92 
 
 
212 aa  221  8e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  50.75 
 
 
202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1628  Superoxide dismutase  53.47 
 
 
201 aa  219  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  52.43 
 
 
203 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1601  Superoxide dismutase  51.87 
 
 
231 aa  219  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7449  manganese and iron superoxide dismutase  52.2 
 
 
244 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3014  Superoxide dismutase  49.75 
 
 
268 aa  218  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  55.38 
 
 
203 aa  218  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2669  Superoxide dismutase  51.21 
 
 
203 aa  217  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.804084  normal  0.155291 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002217  manganese superoxide dismutase  50.25 
 
 
202 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.378947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0464  superoxide dismutase, manganese  51.46 
 
 
209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000102594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5239  superoxide dismutase  48.08 
 
 
208 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5378  superoxide dismutase, Mn  47.6 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000859451  normal  0.033463 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5571  superoxide dismutase, Mn  47.6 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0762  superoxide dismutase (Mn)  52.26 
 
 
201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0276674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5541  superoxide dismutase, Mn  47.6 
 
 
208 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5300  superoxide dismutase, Mn  47.6 
 
 
208 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5142  superoxide dismutase, manganese  47.6 
 
 
208 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0516387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5696  superoxide dismutase, Mn  47.6 
 
 
208 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_4586  superoxide dismutase  51.92 
 
 
211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
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NC_003909  BCE_5579  superoxide dismutase, Mn  47.6 
 
 
208 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_5127  superoxide dismutase, manganese  47.6 
 
 
208 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A5627  superoxide dismutase, Mn  47.6 
 
 
208 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_2282  Superoxide dismutase  50.24 
 
 
209 aa  211  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455124  normal 
 
 
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NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  50 
 
 
204 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
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