More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0946 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  100 
 
 
210 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  99.52 
 
 
241 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  97.04 
 
 
203 aa  410  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  90.05 
 
 
203 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  81.19 
 
 
203 aa  347  9e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  81.19 
 
 
203 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  81.68 
 
 
204 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  80.2 
 
 
203 aa  341  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2669  Superoxide dismutase  77.72 
 
 
203 aa  339  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.804084  normal  0.155291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  75.74 
 
 
203 aa  334  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  76.35 
 
 
204 aa  332  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4459  superoxide dismutase, Mn  79.7 
 
 
203 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  71.78 
 
 
203 aa  317  1e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  70.44 
 
 
203 aa  310  1e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3260  superoxide dismutase  73.13 
 
 
203 aa  309  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  71.36 
 
 
211 aa  295  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2662  superoxide dismutase  73.56 
 
 
210 aa  289  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00481875  normal  0.116987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2282  Superoxide dismutase  67.15 
 
 
209 aa  282  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455124  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  66.83 
 
 
204 aa  280  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  65 
 
 
203 aa  275  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  65 
 
 
203 aa  275  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  65 
 
 
203 aa  275  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  65 
 
 
203 aa  275  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  65 
 
 
203 aa  275  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  65 
 
 
203 aa  275  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  65 
 
 
203 aa  275  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  65 
 
 
203 aa  275  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  65 
 
 
203 aa  275  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  64.36 
 
 
204 aa  275  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  65 
 
 
203 aa  271  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  61.35 
 
 
212 aa  271  5.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  64 
 
 
203 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  62.38 
 
 
205 aa  267  7e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  63.55 
 
 
209 aa  266  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  61.27 
 
 
204 aa  259  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0704  superoxide dismutase  61.03 
 
 
200 aa  250  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1628  Superoxide dismutase  58.59 
 
 
201 aa  247  7e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  56.37 
 
 
204 aa  247  9e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5395  Superoxide dismutase  58.42 
 
 
204 aa  246  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  58.54 
 
 
201 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  56.44 
 
 
203 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2152  Superoxide dismutase  55.56 
 
 
201 aa  242  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0622589 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  57.35 
 
 
202 aa  239  2.9999999999999997e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3725  superoxide dismutase  55.28 
 
 
201 aa  237  6.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  hitchhiker  0.00168961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  57.14 
 
 
203 aa  237  9e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  56.52 
 
 
261 aa  237  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3237  superoxide dismutase  55.28 
 
 
201 aa  235  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  53.81 
 
 
270 aa  235  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  57.43 
 
 
201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0749  superoxide dismutase  52.82 
 
 
240 aa  232  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0072  Superoxide dismutase  55.45 
 
 
208 aa  231  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  54.55 
 
 
199 aa  230  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1645  superoxide dismutase  54.55 
 
 
199 aa  230  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159138  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1611  superoxide dismutase  54.55 
 
 
199 aa  230  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.308425  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4301  superoxide dismutase  57.28 
 
 
206 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4341  superoxide dismutase  57.28 
 
 
206 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000961224 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4385  superoxide dismutase  57.28 
 
 
206 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0287129  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4453  superoxide dismutase  57.28 
 
 
206 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0762  superoxide dismutase (Mn)  55.22 
 
 
201 aa  229  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0276674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03794  superoxide dismutase, Mn  57.28 
 
 
206 aa  228  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4440  superoxide dismutase  57.28 
 
 
206 aa  228  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  57.29 
 
 
201 aa  228  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4387  superoxide dismutase  57.28 
 
 
206 aa  228  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03743  hypothetical protein  57.28 
 
 
206 aa  228  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5362  superoxide dismutase  57.28 
 
 
206 aa  228  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376376  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4063  superoxide dismutase  57.28 
 
 
206 aa  228  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  55.22 
 
 
201 aa  228  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4138  superoxide dismutase  56.8 
 
 
206 aa  227  9e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4076  Superoxide dismutase  56.8 
 
 
206 aa  227  9e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4109  superoxide dismutase  56.8 
 
 
206 aa  227  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4300  superoxide dismutase  56.8 
 
 
206 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.928831  hitchhiker  0.00748774 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  52.28 
 
 
262 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4160  superoxide dismutase  54.5 
 
 
208 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4272  superoxide dismutase  56.8 
 
 
206 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.309361  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  52.28 
 
 
262 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  55.45 
 
 
200 aa  226  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  52.97 
 
 
203 aa  226  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4203  Superoxide dismutase  54.15 
 
 
201 aa  226  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4442  superoxide dismutase  54.5 
 
 
208 aa  225  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0035  superoxide dismutase  54.55 
 
 
207 aa  225  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4121  superoxide dismutase  54.55 
 
 
207 aa  225  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3773  superoxide dismutase  54.55 
 
 
207 aa  225  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2266  superoxide dismutase, Mn  52.43 
 
 
222 aa  224  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000301489  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  54.46 
 
 
209 aa  224  8e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0056  Superoxide dismutase  54.03 
 
 
208 aa  223  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4586  superoxide dismutase  56.94 
 
 
211 aa  223  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  49.75 
 
 
241 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1103  superoxide dismutase  54.63 
 
 
202 aa  222  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.780298  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  52.48 
 
 
206 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0081  superoxide dismutase  55.83 
 
 
206 aa  221  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3014  Superoxide dismutase  50.5 
 
 
268 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0230  hypothetical protein  50.98 
 
 
205 aa  220  9e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.823179 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002217  manganese superoxide dismutase  50.97 
 
 
202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.378947  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4533  superoxide dismutase  49.5 
 
 
254 aa  219  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.0274714 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3962  superoxide dismutase  51.5 
 
 
208 aa  218  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1748  Superoxide dismutase  51.71 
 
 
202 aa  218  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2494  Superoxide dismutase  51.21 
 
 
204 aa  218  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5571  superoxide dismutase, Mn  51.5 
 
 
208 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5378  superoxide dismutase, Mn  51.5 
 
 
208 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000859451  normal  0.033463 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_5239  superoxide dismutase  51.5 
 
 
208 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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