More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2920 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2920  superoxide dismutase  100 
 
 		 210 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  61.9 
 
 		 204 aa  278  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  61.9 
 
 		 204 aa  278  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2494  Superoxide dismutase  61.54 
 
 		 204 aa  274  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  60.48 
 
 		 209 aa  274  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  62.44 
 
 		 203 aa  270  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  60.39 
 
 		 204 aa  269  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  60.39 
 
 		 270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0704  superoxide dismutase  60.5 
 
 		 200 aa  264  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  58.17 
 
 		 203 aa  263  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  59.71 
 
 		 203 aa  260  8.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  59.71 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  59.71 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  59.71 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  59.71 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  59.71 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  59.71 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  59.71 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  59.71 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  59.02 
 
 		 204 aa  258  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  59.22 
 
 		 203 aa  257  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  58.74 
 
 		 203 aa  254  8e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3237  superoxide dismutase  56.59 
 
 		 201 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  54.37 
 
 		 241 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  55.56 
 
 		 205 aa  249  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0749  superoxide dismutase  56.22 
 
 		 240 aa  243  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  55.09 
 
 		 212 aa  242  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3725  superoxide dismutase  54.41 
 
 		 201 aa  241  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  hitchhiker  0.00168961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3014  Superoxide dismutase  56.59 
 
 		 268 aa  241  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  56.67 
 
 		 211 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  52.94 
 
 		 262 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  52.94 
 
 		 262 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  53.85 
 
 		 199 aa  238  5e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2152  Superoxide dismutase  54.46 
 
 		 201 aa  238  5.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0622589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4533  superoxide dismutase  51.94 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.0274714 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1628  Superoxide dismutase  53.47 
 
 		 201 aa  235  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  53.33 
 
 		 204 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  53.62 
 
 		 203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1611  superoxide dismutase  52.4 
 
 		 199 aa  231  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.308425  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1645  superoxide dismutase  52.4 
 
 		 199 aa  231  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159138  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0458  superoxide dismutase  55.77 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3962  superoxide dismutase  51.67 
 
 		 208 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2669  Superoxide dismutase  52.66 
 
 		 203 aa  228  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.804084  normal  0.155291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  52.17 
 
 		 203 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  53.14 
 
 		 203 aa  226  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0119  superoxide dismutase  50.96 
 
 		 199 aa  225  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000118363  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0124  superoxide dismutase  50.96 
 
 		 199 aa  225  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00649836  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0762  superoxide dismutase (Mn)  50.48 
 
 		 201 aa  225  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0276674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5627  superoxide dismutase, Mn  49.76 
 
 		 208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5579  superoxide dismutase, Mn  49.76 
 
 		 208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5541  superoxide dismutase, Mn  49.28 
 
 		 208 aa  224  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5300  superoxide dismutase, Mn  49.28 
 
 		 208 aa  224  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5142  superoxide dismutase, manganese  49.28 
 
 		 208 aa  224  9e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0516387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5696  superoxide dismutase, Mn  49.28 
 
 		 208 aa  224  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5239  superoxide dismutase  49.28 
 
 		 208 aa  224  9e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5378  superoxide dismutase, Mn  48.8 
 
 		 208 aa  223  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000859451  normal  0.033463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4160  superoxide dismutase  50.7 
 
 		 208 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  52.66 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5127  superoxide dismutase, manganese  48.8 
 
 		 208 aa  222  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5571  superoxide dismutase, Mn  48.33 
 
 		 208 aa  222  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  53.27 
 
 		 209 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  50.72 
 
 		 203 aa  221  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3260  superoxide dismutase  51.2 
 
 		 203 aa  221  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4442  superoxide dismutase  49.77 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  51.21 
 
 		 241 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4586  superoxide dismutase  53.74 
 
 		 211 aa  218  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2662  superoxide dismutase  56.13 
 
 		 210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00481875  normal  0.116987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7449  manganese and iron superoxide dismutase  49.28 
 
 		 244 aa  218  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  51.21 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0788  superoxide dismutase, Fe-Mn  51.2 
 
 		 202 aa  218  5e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.319685  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0237  superoxide dismutase  52.58 
 
 		 203 aa  218  6e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000011486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4121  superoxide dismutase  49.3 
 
 		 207 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3773  superoxide dismutase  49.3 
 
 		 207 aa  218  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0035  superoxide dismutase  49.3 
 
 		 207 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  50.24 
 
 		 201 aa  217  7.999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5395  Superoxide dismutase  50.93 
 
 		 204 aa  217  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  49.76 
 
 		 203 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  50.24 
 
 		 203 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2282  Superoxide dismutase  49.54 
 
 		 209 aa  215  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  52.17 
 
 		 201 aa  214  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0072  Superoxide dismutase  49.77 
 
 		 208 aa  214  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  51.18 
 
 		 200 aa  214  7e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  48.56 
 
 		 206 aa  214  9e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  49.76 
 
 		 261 aa  213  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  49.76 
 
 		 203 aa  212  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1897  Superoxide dismutase  47.14 
 
 		 232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  51.42 
 
 		 201 aa  211  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4300  superoxide dismutase  49.53 
 
 		 206 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.928831  hitchhiker  0.00748774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4203  Superoxide dismutase  51.89 
 
 		 201 aa  211  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4063  superoxide dismutase  49.3 
 
 		 206 aa  211  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03794  superoxide dismutase, Mn  49.53 
 
 		 206 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4440  superoxide dismutase  49.53 
 
 		 206 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4387  superoxide dismutase  49.53 
 
 		 206 aa  211  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03743  hypothetical protein  49.53 
 
 		 206 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5362  superoxide dismutase  49.53 
 
 		 206 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376376  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4076  Superoxide dismutase  49.53 
 
 		 206 aa  211  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4138  superoxide dismutase  49.53 
 
 		 206 aa  211  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4109  superoxide dismutase  49.53 
 
 		 206 aa  211  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4385  superoxide dismutase  49.53 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0287129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4341  superoxide dismutase  49.53 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000961224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>