More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4385 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4272  superoxide dismutase  99.51 
 
 
206 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.309361  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4301  superoxide dismutase  100 
 
 
206 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4385  superoxide dismutase  100 
 
 
206 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0287129  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4453  superoxide dismutase  100 
 
 
206 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4341  superoxide dismutase  100 
 
 
206 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000961224 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03794  superoxide dismutase, Mn  98.06 
 
 
206 aa  421  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4076  Superoxide dismutase  97.57 
 
 
206 aa  420  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4387  superoxide dismutase  98.06 
 
 
206 aa  421  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4109  superoxide dismutase  97.57 
 
 
206 aa  420  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4138  superoxide dismutase  97.57 
 
 
206 aa  420  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5362  superoxide dismutase  98.06 
 
 
206 aa  421  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376376  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03743  hypothetical protein  98.06 
 
 
206 aa  421  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4440  superoxide dismutase  98.06 
 
 
206 aa  421  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4300  superoxide dismutase  97.57 
 
 
206 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.928831  hitchhiker  0.00748774 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4063  superoxide dismutase  94.17 
 
 
206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0081  superoxide dismutase  86.41 
 
 
206 aa  377  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3773  superoxide dismutase  85.99 
 
 
207 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0035  superoxide dismutase  85.99 
 
 
207 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4121  superoxide dismutase  85.99 
 
 
207 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0072  Superoxide dismutase  87.25 
 
 
208 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4160  superoxide dismutase  85.99 
 
 
208 aa  371  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4442  superoxide dismutase  85.51 
 
 
208 aa  368  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0056  Superoxide dismutase  84.54 
 
 
208 aa  364  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0464  superoxide dismutase, manganese  80.49 
 
 
209 aa  347  9e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000102594  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  73.21 
 
 
212 aa  312  2.9999999999999996e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0483  manganese superoxide dismutase  69.31 
 
 
207 aa  303  1.0000000000000001e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.286987  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4586  superoxide dismutase  62.32 
 
 
211 aa  258  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  63.29 
 
 
205 aa  256  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  60.1 
 
 
204 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  61.17 
 
 
203 aa  255  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  60.87 
 
 
203 aa  254  9e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  58.65 
 
 
204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2282  Superoxide dismutase  61.27 
 
 
209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455124  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  61.14 
 
 
211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  60.19 
 
 
203 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2662  superoxide dismutase  59.43 
 
 
210 aa  251  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00481875  normal  0.116987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2669  Superoxide dismutase  61.46 
 
 
203 aa  251  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.804084  normal  0.155291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  59.71 
 
 
203 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  59.71 
 
 
203 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  59.71 
 
 
203 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  59.71 
 
 
203 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  59.71 
 
 
203 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  59.71 
 
 
203 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  59.71 
 
 
203 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  59.71 
 
 
203 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  60.19 
 
 
203 aa  249  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  61.46 
 
 
204 aa  247  8e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  57.97 
 
 
203 aa  244  9e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3260  superoxide dismutase  58.74 
 
 
203 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  57.49 
 
 
203 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4459  superoxide dismutase, Mn  58.45 
 
 
203 aa  239  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0749  superoxide dismutase  55.94 
 
 
240 aa  240  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  60 
 
 
201 aa  239  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  57.77 
 
 
204 aa  239  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  57.56 
 
 
209 aa  239  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1628  Superoxide dismutase  58.94 
 
 
201 aa  238  6.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  53.88 
 
 
199 aa  236  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  57.28 
 
 
204 aa  235  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  57.56 
 
 
203 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1645  superoxide dismutase  54.37 
 
 
199 aa  234  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159138  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1611  superoxide dismutase  54.37 
 
 
199 aa  234  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.308425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  58.25 
 
 
201 aa  234  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  58.25 
 
 
203 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0704  superoxide dismutase  57.92 
 
 
200 aa  232  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1897  Superoxide dismutase  55.07 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  56.04 
 
 
203 aa  232  3e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  54.15 
 
 
204 aa  231  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  55.39 
 
 
261 aa  231  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  56.94 
 
 
203 aa  230  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  57.28 
 
 
241 aa  230  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  55.56 
 
 
203 aa  230  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  57.28 
 
 
210 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  54.81 
 
 
201 aa  228  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  55.61 
 
 
203 aa  227  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  54.55 
 
 
209 aa  226  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  54.19 
 
 
203 aa  225  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2152  Superoxide dismutase  54.19 
 
 
201 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0622589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4203  Superoxide dismutase  55.29 
 
 
201 aa  224  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  56.25 
 
 
201 aa  223  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3237  superoxide dismutase  54.63 
 
 
201 aa  223  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3725  superoxide dismutase  53.4 
 
 
201 aa  218  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  hitchhiker  0.00168961 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3962  superoxide dismutase  50.74 
 
 
208 aa  218  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1103  superoxide dismutase  53.59 
 
 
202 aa  218  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.780298  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5571  superoxide dismutase, Mn  49.75 
 
 
208 aa  215  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5378  superoxide dismutase, Mn  49.75 
 
 
208 aa  215  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000859451  normal  0.033463 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0458  superoxide dismutase  55.19 
 
 
206 aa  214  5e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5395  Superoxide dismutase  51.67 
 
 
204 aa  213  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  51.67 
 
 
203 aa  213  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  51.2 
 
 
202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5127  superoxide dismutase, manganese  49.75 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5300  superoxide dismutase, Mn  49.26 
 
 
208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5142  superoxide dismutase, manganese  49.26 
 
 
208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0516387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5696  superoxide dismutase, Mn  49.26 
 
 
208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5541  superoxide dismutase, Mn  49.26 
 
 
208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  50.72 
 
 
200 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5579  superoxide dismutase, Mn  49.26 
 
 
208 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2906  Superoxide dismutase  55.67 
 
 
240 aa  211  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5627  superoxide dismutase, Mn  49.26 
 
 
208 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0762  superoxide dismutase (Mn)  51.44 
 
 
201 aa  211  7e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0276674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5239  superoxide dismutase  49.26 
 
 
208 aa  210  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>