More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2086 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  100 
 
 
226 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  97.1 
 
 
208 aa  414  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  77.07 
 
 
208 aa  334  7e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  71.84 
 
 
209 aa  319  1.9999999999999998e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  71.84 
 
 
209 aa  319  1.9999999999999998e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  76 
 
 
204 aa  318  6e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  72.5 
 
 
204 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  69.42 
 
 
209 aa  300  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  67 
 
 
206 aa  295  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  67.96 
 
 
207 aa  295  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  67.96 
 
 
207 aa  294  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  67.96 
 
 
207 aa  294  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  67.96 
 
 
207 aa  294  8e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  65.53 
 
 
207 aa  285  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  70.41 
 
 
200 aa  285  5e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  68.21 
 
 
207 aa  282  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  65.02 
 
 
209 aa  276  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  63.59 
 
 
299 aa  275  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  62.32 
 
 
209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  63.02 
 
 
202 aa  269  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  62.93 
 
 
207 aa  269  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  62.56 
 
 
207 aa  268  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  62.24 
 
 
203 aa  264  7e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  59.6 
 
 
200 aa  260  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  59.41 
 
 
207 aa  260  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  59.51 
 
 
209 aa  259  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  61.62 
 
 
203 aa  258  6e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  51.04 
 
 
269 aa  226  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  51.53 
 
 
198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  52.66 
 
 
198 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  46.94 
 
 
348 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  48.47 
 
 
437 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  47.45 
 
 
304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  46.94 
 
 
304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  47.45 
 
 
304 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  47.45 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  47.45 
 
 
304 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  47.45 
 
 
304 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  47.45 
 
 
304 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  47.45 
 
 
304 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  47.45 
 
 
304 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  47.45 
 
 
304 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  47.45 
 
 
304 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  46.35 
 
 
226 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  46.91 
 
 
197 aa  192  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  52.31 
 
 
208 aa  191  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  43.14 
 
 
206 aa  189  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31067  Mn-Superoxide dismutase  46.11 
 
 
224 aa  188  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.076255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  45.6 
 
 
195 aa  188  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  47.26 
 
 
261 aa  187  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.182607 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  46.63 
 
 
223 aa  186  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  45.71 
 
 
212 aa  186  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  48.42 
 
 
199 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  46.27 
 
 
205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  46.77 
 
 
208 aa  180  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  48.5 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  46.04 
 
 
204 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  40.87 
 
 
223 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  42.27 
 
 
241 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  46.23 
 
 
205 aa  177  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  45.54 
 
 
204 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34151  manganese-superoxide dismutase  44.44 
 
 
227 aa  176  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.096588  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  44.67 
 
 
203 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  45.18 
 
 
203 aa  174  7e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  43.9 
 
 
203 aa  174  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  44.16 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  44.88 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  44.06 
 
 
203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  45.85 
 
 
204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  44 
 
 
204 aa  172  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  43.63 
 
 
203 aa  171  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  43.72 
 
 
204 aa  171  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  43.56 
 
 
210 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  43.72 
 
 
209 aa  171  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_002620  TC0567  superoxide dismutase  44.16 
 
 
207 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  43.5 
 
 
203 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  43.58 
 
 
211 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42832  mutase superoxide dismutase  42.78 
 
 
226 aa  170  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1103  superoxide dismutase  45.27 
 
 
202 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.780298  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63831  manganese-superoxide dismutase  43.78 
 
 
208 aa  171  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  46 
 
 
201 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 
203 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 
203 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 
203 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 
203 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 
203 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 
203 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 
203 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 
203 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  42.44 
 
 
203 aa  169  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0749  superoxide dismutase  43.37 
 
 
240 aa  169  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  42.49 
 
 
223 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2494  Superoxide dismutase  46.6 
 
 
204 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  42.79 
 
 
206 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  41.95 
 
 
211 aa  169  4e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  40.2 
 
 
217 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  42.79 
 
 
209 aa  168  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  40.37 
 
 
225 aa  168  8e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  43.78 
 
 
201 aa  168  8e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  42.44 
 
 
203 aa  167  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>