More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0492 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  66.5 
 
 		 207 aa  299  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  65.22 
 
 		 299 aa  297  9e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  64.18 
 
 		 202 aa  291  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  64.5 
 
 		 200 aa  288  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  64.65 
 
 		 203 aa  281  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  60.19 
 
 		 207 aa  270  9e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  60.19 
 
 		 207 aa  270  9e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  60.19 
 
 		 207 aa  270  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  60.39 
 
 		 208 aa  270  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  58.94 
 
 		 209 aa  266  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  58.94 
 
 		 209 aa  267  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  60.58 
 
 		 208 aa  263  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  57.77 
 
 		 207 aa  261  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  63.45 
 
 		 204 aa  261  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  59.51 
 
 		 226 aa  259  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  61.31 
 
 		 200 aa  258  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  59.6 
 
 		 203 aa  258  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  58.42 
 
 		 204 aa  252  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  56.04 
 
 		 207 aa  244  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  54.33 
 
 		 209 aa  244  9e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  55.07 
 
 		 206 aa  244  9e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  56.25 
 
 		 209 aa  241  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  54.59 
 
 		 207 aa  231  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  52.4 
 
 		 209 aa  228  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  50 
 
 		 207 aa  224  9e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  50.24 
 
 		 207 aa  214  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  42.49 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 304 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  44.9 
 
 		 348 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 304 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 304 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  45.13 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  45.13 
 
 		 304 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 304 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 304 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 304 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 304 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 304 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  45.92 
 
 		 437 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  45.13 
 
 		 304 aa  180  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  43.98 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  45.88 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  42.78 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  44.79 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  43.52 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  42.16 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  40.61 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  43.23 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  43.59 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  40.78 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31067  Mn-Superoxide dismutase  39.9 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.076255  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  40.78 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  43.68 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  40.39 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  44.72 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  42.42 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  41.92 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  40 
 
 		 223 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  40.1 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  39.11 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34151  manganese-superoxide dismutase  41.46 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.096588  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  38.31 
 
 		 225 aa  157  8e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  36.89 
 
 		 206 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  41.5 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42832  mutase superoxide dismutase  39.59 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0567  superoxide dismutase  38.38 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  40.59 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  40.8 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3962  superoxide dismutase  38.94 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5378  superoxide dismutase, Mn  38.46 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000859451  normal  0.033463 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5579  superoxide dismutase, Mn  38.46 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5627  superoxide dismutase, Mn  38.46 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5571  superoxide dismutase, Mn  38.46 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63831  manganese-superoxide dismutase  40.61 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5541  superoxide dismutase, Mn  38.46 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5300  superoxide dismutase, Mn  38.46 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5142  superoxide dismutase, manganese  38.46 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0516387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5696  superoxide dismutase, Mn  38.46 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1705  superoxide dismutase  39.9 
 
 		 205 aa  151  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  41.67 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  40.78 
 
 		 203 aa  151  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1748  Superoxide dismutase  38 
 
 		 202 aa  151  8e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  43.28 
 
 		 201 aa  150  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5127  superoxide dismutase, manganese  37.5 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  37.06 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5239  superoxide dismutase  37.98 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  41.5 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  41.18 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  39.81 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  40.59 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  38 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.209664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>