More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2817 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  100 
 
 		 203 aa  410  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  81 
 
 		 203 aa  343  8e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  69.46 
 
 		 299 aa  310  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  68.5 
 
 		 202 aa  304  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  70 
 
 		 200 aa  304  7e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  67.17 
 
 		 204 aa  288  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  66 
 
 		 204 aa  283  8e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  64.65 
 
 		 209 aa  281  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  64.36 
 
 		 207 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  64.36 
 
 		 207 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  64.36 
 
 		 207 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  65.48 
 
 		 207 aa  267  8e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  60.89 
 
 		 209 aa  261  4.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  60.89 
 
 		 209 aa  261  6.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  61.19 
 
 		 208 aa  260  8e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  63 
 
 		 200 aa  259  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  61.62 
 
 		 226 aa  258  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  60.61 
 
 		 207 aa  257  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  59.09 
 
 		 206 aa  257  8e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  60.4 
 
 		 208 aa  256  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  62.03 
 
 		 209 aa  251  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  61.31 
 
 		 209 aa  251  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  60.1 
 
 		 207 aa  250  8.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  59.41 
 
 		 209 aa  250  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  59.89 
 
 		 207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  57.43 
 
 		 207 aa  242  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 207 aa  238  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  51.55 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  50.53 
 
 		 198 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  46.07 
 
 		 269 aa  197  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 304 aa  188  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 304 aa  188  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  46.94 
 
 		 197 aa  187  9e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  46.67 
 
 		 304 aa  186  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  44.62 
 
 		 348 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 304 aa  185  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 304 aa  185  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 304 aa  185  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 304 aa  185  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 304 aa  185  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 304 aa  185  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 304 aa  185  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  46.15 
 
 		 304 aa  185  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  46.63 
 
 		 223 aa  184  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  44.79 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31067  Mn-Superoxide dismutase  44.62 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.076255  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  48.98 
 
 		 208 aa  181  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  48.95 
 
 		 199 aa  181  9.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  45.13 
 
 		 437 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  44.67 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  44.28 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  39.9 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  43.08 
 
 		 223 aa  168  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  41.88 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34151  manganese-superoxide dismutase  44.39 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.096588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  43.3 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  44.1 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  45.23 
 
 		 211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  40.91 
 
 		 223 aa  164  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  40.29 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42832  mutase superoxide dismutase  41.33 
 
 		 226 aa  162  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  41.87 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  45.18 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0567  superoxide dismutase  40.5 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  44.22 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63831  manganese-superoxide dismutase  42.64 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  41.54 
 
 		 205 aa  158  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  41.62 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  40.59 
 
 		 204 aa  157  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  39.8 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  41.03 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1705  superoxide dismutase  41.12 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  42.35 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  43.23 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  40.1 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  39.13 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  40.1 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  40.89 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  40.1 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  40.5 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  38.58 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3962  superoxide dismutase  38.73 
 
 		 208 aa  148  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  40 
 
 		 203 aa  148  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  40.38 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1628  Superoxide dismutase  40.91 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  39.3 
 
 		 203 aa  148  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00785  mitochondrial superoxide dismutase (Eurofung)  42.35 
 
 		 213 aa  147  8e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.852927 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  39.2 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  39.9 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  39.5 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  39.9 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  39.15 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  39.71 
 
 		 261 aa  146  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  43.78 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  41.79 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  39.02 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1292  Superoxide dismutase  41.21 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  39.02 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  39.02 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>