More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2178 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  100 
 
 
200 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  88.5 
 
 
200 aa  347  6e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  85.79 
 
 
205 aa  345  3e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  84.77 
 
 
199 aa  338  2.9999999999999998e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  79.4 
 
 
203 aa  304  7e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  72.5 
 
 
200 aa  296  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  70.5 
 
 
200 aa  288  5.0000000000000004e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  72.86 
 
 
203 aa  283  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  47.45 
 
 
198 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  48.72 
 
 
437 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  46.15 
 
 
348 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  44.39 
 
 
198 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  46.23 
 
 
206 aa  175  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  47.74 
 
 
207 aa  174  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  43.65 
 
 
207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  44.16 
 
 
204 aa  171  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  44.33 
 
 
197 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  44.22 
 
 
209 aa  170  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  42.27 
 
 
203 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  43.72 
 
 
208 aa  169  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  46.03 
 
 
207 aa  167  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  42.13 
 
 
203 aa  167  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  42.56 
 
 
226 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  42.56 
 
 
304 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  42.21 
 
 
208 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  41.03 
 
 
304 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  42.71 
 
 
269 aa  165  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  42.05 
 
 
304 aa  165  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  42.05 
 
 
304 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  42.05 
 
 
304 aa  165  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  42.05 
 
 
304 aa  165  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  42.05 
 
 
304 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  42.05 
 
 
304 aa  165  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  42.05 
 
 
304 aa  165  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  41.03 
 
 
304 aa  165  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  41.03 
 
 
304 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  41.71 
 
 
226 aa  164  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  42.86 
 
 
204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  42.64 
 
 
299 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  41.71 
 
 
209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  41.71 
 
 
209 aa  162  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  41.5 
 
 
209 aa  162  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  44.22 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  42.13 
 
 
207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  40.4 
 
 
202 aa  161  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  40.61 
 
 
200 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  40.7 
 
 
207 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  40.7 
 
 
207 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  40.7 
 
 
207 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  39.38 
 
 
195 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  43.39 
 
 
209 aa  159  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  42 
 
 
211 aa  157  7e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  40.91 
 
 
200 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  42.86 
 
 
203 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  42.64 
 
 
214 aa  156  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  42.57 
 
 
209 aa  155  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  43.28 
 
 
204 aa  154  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  38.46 
 
 
223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  41.12 
 
 
211 aa  151  5e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  38.58 
 
 
223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  42.79 
 
 
204 aa  151  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  41.09 
 
 
209 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  39.2 
 
 
207 aa  148  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  38.89 
 
 
241 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  36 
 
 
225 aa  147  9e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  41.29 
 
 
203 aa  147  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  40.2 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  40 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  42.08 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  39.49 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  39.3 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  40.2 
 
 
203 aa  145  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  40.2 
 
 
203 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  40.2 
 
 
203 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  40.2 
 
 
203 aa  145  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  40.2 
 
 
203 aa  145  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  40.2 
 
 
203 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  40.53 
 
 
199 aa  145  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  40.2 
 
 
203 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  40.2 
 
 
203 aa  145  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  41.18 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3260  superoxide dismutase  41.29 
 
 
203 aa  143  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  43.28 
 
 
203 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  39.71 
 
 
203 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  40.78 
 
 
212 aa  142  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  41.38 
 
 
204 aa  142  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1705  superoxide dismutase  40.91 
 
 
205 aa  142  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  41.33 
 
 
205 aa  141  7e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  42.29 
 
 
204 aa  141  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  38.61 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  35.03 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  39.29 
 
 
270 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4063  superoxide dismutase  41.18 
 
 
206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  39.71 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  39.41 
 
 
204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  43.23 
 
 
199 aa  139  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  37.86 
 
 
262 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  37.86 
 
 
262 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0749  superoxide dismutase  35.47 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  39.52 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>