More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1236 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  100 
 
 
198 aa  407  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  76.14 
 
 
198 aa  324  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  72.68 
 
 
197 aa  301  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  73.96 
 
 
199 aa  295  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  62.37 
 
 
348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  62.89 
 
 
437 aa  267  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  60 
 
 
226 aa  259  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  58.85 
 
 
304 aa  256  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  58.85 
 
 
304 aa  256  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  58.85 
 
 
304 aa  256  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  58.76 
 
 
304 aa  255  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  58.76 
 
 
304 aa  255  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  58.76 
 
 
304 aa  255  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  58.76 
 
 
304 aa  255  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  58.76 
 
 
304 aa  255  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  58.76 
 
 
304 aa  255  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  58.76 
 
 
304 aa  255  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  58.33 
 
 
304 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  57.95 
 
 
195 aa  249  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  56.25 
 
 
223 aa  244  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  54.82 
 
 
223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  55.56 
 
 
217 aa  234  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  51.56 
 
 
269 aa  219  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  52.28 
 
 
204 aa  214  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  51.53 
 
 
226 aa  213  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  52.06 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  52.58 
 
 
206 aa  211  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  53.09 
 
 
207 aa  210  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  50.26 
 
 
204 aa  209  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  50.52 
 
 
209 aa  209  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  49.48 
 
 
207 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  51.55 
 
 
203 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  54.35 
 
 
207 aa  208  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  55.1 
 
 
214 aa  206  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  52.72 
 
 
209 aa  205  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  48.47 
 
 
202 aa  203  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  49.48 
 
 
208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  49.01 
 
 
206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  48.97 
 
 
299 aa  197  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  47.96 
 
 
203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  47.42 
 
 
209 aa  195  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  48.47 
 
 
207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  48.47 
 
 
207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  48.47 
 
 
207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  49.48 
 
 
200 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  47.42 
 
 
209 aa  193  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  47.72 
 
 
207 aa  191  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  47.45 
 
 
207 aa  188  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  47.18 
 
 
208 aa  187  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  49.49 
 
 
211 aa  186  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  49.49 
 
 
211 aa  186  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  50.51 
 
 
209 aa  186  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  45.13 
 
 
209 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  48.73 
 
 
211 aa  184  6e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  47.45 
 
 
200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  43.84 
 
 
203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  44.67 
 
 
207 aa  181  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  44.88 
 
 
204 aa  181  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  46.08 
 
 
209 aa  180  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  44.39 
 
 
204 aa  180  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0729  superoxide dismutase  43.84 
 
 
207 aa  179  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  47.69 
 
 
203 aa  179  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  45.32 
 
 
204 aa  178  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  43.94 
 
 
270 aa  178  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  44.1 
 
 
200 aa  177  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  47.42 
 
 
203 aa  177  8e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  44.33 
 
 
204 aa  177  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  43.22 
 
 
241 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  42.78 
 
 
209 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  44.9 
 
 
200 aa  175  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  45.1 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  46.94 
 
 
200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2494  Superoxide dismutase  45.32 
 
 
204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  44.95 
 
 
199 aa  171  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  42.79 
 
 
241 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  44.44 
 
 
205 aa  171  7.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  49.5 
 
 
208 aa  171  9e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  42.79 
 
 
210 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  46.23 
 
 
206 aa  168  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  42.86 
 
 
203 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  42.36 
 
 
204 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  45.41 
 
 
200 aa  168  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  43.13 
 
 
212 aa  167  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3014  Superoxide dismutase  44.72 
 
 
268 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  42.79 
 
 
203 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  41.41 
 
 
203 aa  166  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0749  superoxide dismutase  42.13 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  41.55 
 
 
203 aa  165  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  43.72 
 
 
209 aa  164  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  40.58 
 
 
203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  42.36 
 
 
203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  41.41 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  41.41 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00022  superoxide dismutase  43.9 
 
 
235 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00410451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  41.79 
 
 
203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  41.79 
 
 
203 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  41.79 
 
 
203 aa  162  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  41.79 
 
 
203 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  41.79 
 
 
203 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  41.79 
 
 
203 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>