More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01340 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  100 
 
 		 207 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  71.01 
 
 		 206 aa  310  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  71.57 
 
 		 204 aa  295  3e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  69.7 
 
 		 207 aa  293  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  71.66 
 
 		 209 aa  288  4e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  66.18 
 
 		 208 aa  287  6e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  68.18 
 
 		 207 aa  287  7e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  64.25 
 
 		 209 aa  286  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  70.59 
 
 		 207 aa  286  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  64.25 
 
 		 209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  67.51 
 
 		 204 aa  284  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  65.38 
 
 		 208 aa  283  9e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  68.21 
 
 		 226 aa  282  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  67.17 
 
 		 209 aa  280  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  65.83 
 
 		 200 aa  268  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  63.32 
 
 		 207 aa  268  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  63.32 
 
 		 207 aa  268  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  63.32 
 
 		 207 aa  268  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  60.39 
 
 		 299 aa  261  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  59.13 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  57.77 
 
 		 207 aa  247  9e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  59.3 
 
 		 200 aa  247  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  59.28 
 
 		 202 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  55.94 
 
 		 207 aa  241  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  58.55 
 
 		 203 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  57.07 
 
 		 203 aa  238  6.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  54.59 
 
 		 209 aa  231  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  48.44 
 
 		 269 aa  211  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  50.26 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  46.19 
 
 		 348 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  51.79 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  48.19 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31067  Mn-Superoxide dismutase  46.63 
 
 		 224 aa  192  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.076255  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  47.72 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  45.18 
 
 		 304 aa  190  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 304 aa  190  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 304 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 304 aa  190  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 304 aa  190  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  46.7 
 
 		 437 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 304 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 304 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 304 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  45.18 
 
 		 304 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  45.18 
 
 		 304 aa  189  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  44.67 
 
 		 304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  46.35 
 
 		 195 aa  187  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  44.5 
 
 		 198 aa  187  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  45.32 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0567  superoxide dismutase  48.47 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  46.67 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  48 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  46.07 
 
 		 199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  47.45 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1705  superoxide dismutase  47.69 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  41.26 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  43.94 
 
 		 203 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  44.27 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  47.21 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  45.67 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  46.43 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  47.06 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63831  manganese-superoxide dismutase  43.65 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  47.47 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34151  manganese-superoxide dismutase  43.81 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.096588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42832  mutase superoxide dismutase  43.37 
 
 		 226 aa  174  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  46.6 
 
 		 209 aa  174  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  45.92 
 
 		 209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  45.41 
 
 		 211 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  42.71 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  42.35 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4063  superoxide dismutase  48.02 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0072  Superoxide dismutase  46.38 
 
 		 208 aa  167  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0056  Superoxide dismutase  47.12 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  46.97 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  44.22 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2669  Superoxide dismutase  44.06 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.804084  normal  0.155291 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1103  superoxide dismutase  45.54 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.780298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  45.85 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  44.16 
 
 		 214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  42.08 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  44.17 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  46.34 
 
 		 204 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  44.33 
 
 		 204 aa  164  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  40.2 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0729  superoxide dismutase  41.09 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  44.12 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0464  superoxide dismutase, manganese  47.06 
 
 		 209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000102594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  43.56 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  44.06 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03794  superoxide dismutase, Mn  46.53 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4387  superoxide dismutase  46.53 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5362  superoxide dismutase  46.53 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4440  superoxide dismutase  46.53 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  42.44 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03743  hypothetical protein  46.53 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4076  Superoxide dismutase  46.04 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4138  superoxide dismutase  46.04 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4109  superoxide dismutase  46.04 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  44 
 
 		 204 aa  161  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>