More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1503 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  100 
 
 		 205 aa  423  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  71.36 
 
 		 208 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  65.67 
 
 		 206 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  64.68 
 
 		 208 aa  277  9e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  61.08 
 
 		 203 aa  261  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1705  superoxide dismutase  63.82 
 
 		 205 aa  249  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  56.35 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  53.23 
 
 		 211 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  52.5 
 
 		 211 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  51.74 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  49.25 
 
 		 207 aa  202  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  49.49 
 
 		 206 aa  194  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  48.74 
 
 		 204 aa  194  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  45.73 
 
 		 348 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  47.74 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  47.69 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  46.73 
 
 		 208 aa  188  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 304 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 304 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 304 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 304 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 304 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 304 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 304 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  46.73 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  46.5 
 
 		 437 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  41.71 
 
 		 269 aa  186  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  49.47 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  46.94 
 
 		 200 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 304 aa  185  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  44.78 
 
 		 304 aa  185  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  50 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  47.94 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  47.94 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  47.94 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  45.18 
 
 		 304 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  48 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  44.28 
 
 		 203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  48 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  44.9 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  43.72 
 
 		 304 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  47.69 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  46.23 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  47.74 
 
 		 208 aa  181  6e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  46.67 
 
 		 200 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  44.95 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  42.93 
 
 		 299 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  46.43 
 
 		 198 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  47.34 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  43.15 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1292  Superoxide dismutase  45.73 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  46.91 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  43.43 
 
 		 209 aa  178  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  43.59 
 
 		 195 aa  178  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  46 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  44.85 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  44.85 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  44.9 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  42.78 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_002620  TC0567  superoxide dismutase  43.28 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  44.85 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  43 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  40.1 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  41.75 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  39.13 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  43.15 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  41.31 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0729  superoxide dismutase  40 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  36.14 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  39.81 
 
 		 203 aa  158  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  41.46 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1889  superoxide dismutase  43.22 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.61793 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  41.95 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  41.54 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0214  superoxide dismutase  41.12 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  40.29 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6857  Superoxide dismutase  40.39 
 
 		 197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0552512 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  43.56 
 
 		 200 aa  154  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  39.17 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  38.81 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  39.71 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  42 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  43.88 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  43.88 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  43.88 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  40.2 
 
 		 261 aa  152  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  43.88 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  43.88 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  43.88 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  39.81 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  43.88 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  43.88 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  42.27 
 
 		 192 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  41.09 
 
 		 205 aa  152  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  40.19 
 
 		 241 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  39.81 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  39.71 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2494  Superoxide dismutase  42.29 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  43.37 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  42.35 
 
 		 233 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>