More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2167 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  100 
 
 
211 aa  434  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  95.73 
 
 
211 aa  387  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  95.26 
 
 
211 aa  386  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  87.86 
 
 
209 aa  360  1e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  56.35 
 
 
348 aa  235  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  55.9 
 
 
269 aa  231  5e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  53.4 
 
 
206 aa  222  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  54.31 
 
 
437 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  54.5 
 
 
208 aa  218  6e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1705  superoxide dismutase  54.5 
 
 
205 aa  217  7.999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  51.24 
 
 
208 aa  217  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1292  Superoxide dismutase  53.2 
 
 
211 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  49.04 
 
 
223 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  50 
 
 
223 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  53.23 
 
 
205 aa  211  9e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  53.57 
 
 
304 aa  209  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  53.57 
 
 
304 aa  208  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  53.57 
 
 
304 aa  208  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  53.57 
 
 
304 aa  208  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  53.57 
 
 
304 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  53.57 
 
 
304 aa  208  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  53.57 
 
 
304 aa  208  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  53.57 
 
 
304 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  53.57 
 
 
304 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  53.57 
 
 
304 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  52.04 
 
 
304 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  49.25 
 
 
198 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  45.13 
 
 
203 aa  205  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  50.52 
 
 
195 aa  204  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  48.99 
 
 
217 aa  204  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  51.01 
 
 
198 aa  204  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  48.74 
 
 
204 aa  201  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1889  superoxide dismutase  49.51 
 
 
210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.61793 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  52.06 
 
 
199 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  48.98 
 
 
200 aa  194  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  47.57 
 
 
226 aa  194  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  48.48 
 
 
200 aa  194  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  45.27 
 
 
202 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0214  superoxide dismutase  49.5 
 
 
208 aa  192  4e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  45.63 
 
 
209 aa  192  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  45.63 
 
 
209 aa  191  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  46.34 
 
 
208 aa  191  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  47.45 
 
 
207 aa  190  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  45.69 
 
 
207 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  44.88 
 
 
207 aa  190  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  43.9 
 
 
299 aa  190  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  50 
 
 
197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  47.47 
 
 
209 aa  188  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  45.05 
 
 
204 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  45.92 
 
 
206 aa  186  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  44.12 
 
 
209 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  44.9 
 
 
209 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  44.39 
 
 
208 aa  185  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  44.72 
 
 
226 aa  184  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  47.85 
 
 
207 aa  184  8e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  44.66 
 
 
207 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  44.66 
 
 
207 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  44.66 
 
 
207 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  46.88 
 
 
203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  47.85 
 
 
209 aa  181  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  44.88 
 
 
206 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  46.23 
 
 
207 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  46.7 
 
 
203 aa  178  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  45.77 
 
 
214 aa  175  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  43.35 
 
 
207 aa  174  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  45.32 
 
 
203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0567  superoxide dismutase  44.16 
 
 
207 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  46.19 
 
 
212 aa  168  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  45.41 
 
 
209 aa  168  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  46.38 
 
 
204 aa  167  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0729  superoxide dismutase  42.58 
 
 
207 aa  167  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  43.94 
 
 
200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  43 
 
 
241 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  45.15 
 
 
204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  42.86 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  43.94 
 
 
200 aa  162  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  44.17 
 
 
204 aa  162  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  43.15 
 
 
199 aa  161  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  40.95 
 
 
270 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  42.86 
 
 
203 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  43.33 
 
 
203 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  43.84 
 
 
203 aa  159  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  42.16 
 
 
203 aa  159  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  44.02 
 
 
241 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  42.71 
 
 
200 aa  157  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  43.2 
 
 
204 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  44.23 
 
 
210 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  42.16 
 
 
225 aa  156  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  42.38 
 
 
203 aa  156  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  41.71 
 
 
262 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  43.54 
 
 
203 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  41.71 
 
 
262 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0464  superoxide dismutase, manganese  41.98 
 
 
209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000102594  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  44.71 
 
 
203 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  42.51 
 
 
204 aa  154  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  40.4 
 
 
223 aa  153  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  42.23 
 
 
203 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3962  superoxide dismutase  40.48 
 
 
208 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  41.87 
 
 
203 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3014  Superoxide dismutase  39.51 
 
 
268 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>