More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2542 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  100 
 
 
203 aa  414  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  82.76 
 
 
203 aa  335  2.9999999999999997e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  81.41 
 
 
200 aa  327  7e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  78.89 
 
 
200 aa  323  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  79.31 
 
 
200 aa  305  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  79.4 
 
 
200 aa  305  4.0000000000000004e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  76.02 
 
 
205 aa  297  9e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  75.51 
 
 
199 aa  293  2e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  47.94 
 
 
198 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  50 
 
 
437 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  46.35 
 
 
348 aa  191  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  45.13 
 
 
198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  45.83 
 
 
197 aa  182  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  44.74 
 
 
269 aa  172  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  41.67 
 
 
304 aa  171  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  41.67 
 
 
304 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  42.19 
 
 
304 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  42.19 
 
 
304 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  42.19 
 
 
304 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  42.19 
 
 
304 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  42.19 
 
 
195 aa  171  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  42.19 
 
 
304 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  42.19 
 
 
304 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  42.19 
 
 
304 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  41.15 
 
 
304 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  44.67 
 
 
209 aa  169  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  41.67 
 
 
304 aa  168  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  43.63 
 
 
211 aa  164  8e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  41.24 
 
 
226 aa  163  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  42.19 
 
 
204 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  45 
 
 
204 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  38.66 
 
 
223 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  44.28 
 
 
209 aa  159  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  42.65 
 
 
211 aa  159  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  42.71 
 
 
206 aa  157  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  44 
 
 
204 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  44.51 
 
 
207 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  42.7 
 
 
199 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  40.41 
 
 
207 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  43.5 
 
 
202 aa  155  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  41.5 
 
 
203 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  42 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  38.78 
 
 
223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  39.69 
 
 
203 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  39.8 
 
 
207 aa  154  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  40 
 
 
241 aa  154  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  39.8 
 
 
225 aa  154  9e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  40.21 
 
 
299 aa  153  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  39.69 
 
 
204 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  41.67 
 
 
211 aa  154  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  39.5 
 
 
208 aa  153  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  41.09 
 
 
208 aa  153  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  39.15 
 
 
203 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  38.54 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  40.21 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  42.86 
 
 
209 aa  152  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  38.54 
 
 
226 aa  152  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  41.33 
 
 
214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  37.82 
 
 
202 aa  151  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  41.79 
 
 
204 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2494  Superoxide dismutase  42.08 
 
 
204 aa  149  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  40.96 
 
 
203 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  39.9 
 
 
209 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  42.71 
 
 
204 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  42.27 
 
 
207 aa  148  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  40.7 
 
 
262 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  40.7 
 
 
262 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  38.81 
 
 
207 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  38.81 
 
 
207 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  38.81 
 
 
207 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  39.06 
 
 
200 aa  147  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1705  superoxide dismutase  45.13 
 
 
205 aa  148  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  42 
 
 
203 aa  147  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  38.97 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  42.71 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  38 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  38 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3260  superoxide dismutase  43.35 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  42.71 
 
 
241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  40.2 
 
 
206 aa  145  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  39.3 
 
 
209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  40.1 
 
 
203 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  42.21 
 
 
203 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  40.09 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  40.09 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  40.09 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  40.09 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  41.45 
 
 
205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  40.09 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  37.5 
 
 
206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  40.09 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  40.09 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  40.09 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  41.98 
 
 
203 aa  144  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  42.5 
 
 
203 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  40.09 
 
 
203 aa  144  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  42.71 
 
 
201 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  39.5 
 
 
270 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  39.29 
 
 
217 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  35.94 
 
 
209 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>