More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0229 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  100 
 
 		 209 aa  428  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  88.29 
 
 		 211 aa  358  3e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  88.78 
 
 		 211 aa  357  9e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  88.35 
 
 		 211 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  54.82 
 
 		 348 aa  232  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  55.38 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1705  superoxide dismutase  56.5 
 
 		 205 aa  223  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1292  Superoxide dismutase  54.85 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  53.96 
 
 		 206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  52.79 
 
 		 437 aa  218  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  56.35 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  55.61 
 
 		 208 aa  215  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  52.68 
 
 		 208 aa  214  7e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 304 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 304 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  46.94 
 
 		 203 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 304 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 304 aa  211  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 304 aa  211  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 304 aa  211  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 304 aa  211  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 304 aa  211  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 304 aa  211  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 304 aa  211  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  51.03 
 
 		 304 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  47.55 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1889  superoxide dismutase  50.73 
 
 		 210 aa  204  5e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.61793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  47.98 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  50.51 
 
 		 198 aa  201  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0214  superoxide dismutase  51.78 
 
 		 208 aa  201  9e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  49.25 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  51.02 
 
 		 197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  47.52 
 
 		 223 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  48.21 
 
 		 195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  47.98 
 
 		 226 aa  193  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  48.47 
 
 		 204 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  47.5 
 
 		 209 aa  191  9e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  47.29 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  47.5 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  50.75 
 
 		 200 aa  188  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  46.73 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  43.56 
 
 		 202 aa  184  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  46.53 
 
 		 207 aa  184  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  45.73 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  46 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  43.41 
 
 		 299 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  46.94 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  45.73 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  44.39 
 
 		 206 aa  181  7e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  44.28 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  48.97 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  45.81 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  44.72 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  46.5 
 
 		 241 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  44.9 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  44.79 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  42.71 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  42.36 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  43.84 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  46.77 
 
 		 207 aa  174  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  47.59 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  44.28 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  44.28 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  44.88 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  44.28 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  44.28 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  44.61 
 
 		 270 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  45.27 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0567  superoxide dismutase  43 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  44.95 
 
 		 205 aa  171  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  44.44 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  44.28 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  44.17 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  46.08 
 
 		 204 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  44.55 
 
 		 212 aa  169  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  43.78 
 
 		 200 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0729  superoxide dismutase  42.58 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  45.41 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  43.88 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  44 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  43.84 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3014  Superoxide dismutase  41.26 
 
 		 268 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  43.84 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  43.63 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  43.84 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  42.86 
 
 		 204 aa  160  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  41.41 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  43.65 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  43.33 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  43.63 
 
 		 203 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  42 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  44 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0749  superoxide dismutase  39.02 
 
 		 240 aa  156  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  42.38 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  44.44 
 
 		 241 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1046  superoxide dismutase  42.93 
 
 		 246 aa  154  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675298  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  42.16 
 
 		 210 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4533  superoxide dismutase  40.2 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.0274714 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  40.58 
 
 		 204 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0704  superoxide dismutase  42.35 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>