More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1705 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1705  superoxide dismutase  100 
 
 
205 aa  430  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  67.01 
 
 
206 aa  275  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  63.32 
 
 
208 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  65.35 
 
 
208 aa  260  8.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  63.82 
 
 
205 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  57.36 
 
 
203 aa  248  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  57 
 
 
209 aa  231  6e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  55.5 
 
 
211 aa  226  2e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  55 
 
 
211 aa  224  8e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  54.5 
 
 
211 aa  221  6e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1292  Superoxide dismutase  50.74 
 
 
211 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  49.23 
 
 
207 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  48.47 
 
 
204 aa  193  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  47.72 
 
 
348 aa  191  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  47.18 
 
 
198 aa  188  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  43.88 
 
 
195 aa  186  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  44.56 
 
 
203 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  46.67 
 
 
206 aa  186  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  46.43 
 
 
204 aa  184  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  46.15 
 
 
198 aa  184  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  45.73 
 
 
223 aa  184  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  45.18 
 
 
207 aa  184  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0214  superoxide dismutase  46.34 
 
 
208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  46.84 
 
 
209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  43.94 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  45.96 
 
 
208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  47.42 
 
 
304 aa  182  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  46.39 
 
 
200 aa  182  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  47.42 
 
 
304 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  47.42 
 
 
304 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  47.42 
 
 
304 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  47.42 
 
 
304 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  47.42 
 
 
304 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  47.42 
 
 
304 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  45.45 
 
 
226 aa  181  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  46.43 
 
 
197 aa  181  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1889  superoxide dismutase  48.54 
 
 
210 aa  181  7e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.61793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  46.32 
 
 
207 aa  181  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  45.18 
 
 
209 aa  180  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  43.5 
 
 
202 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  46.91 
 
 
304 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  44.44 
 
 
208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  46.39 
 
 
304 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  46.39 
 
 
304 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  46.67 
 
 
437 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  42.42 
 
 
299 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  43.94 
 
 
209 aa  176  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  44.16 
 
 
200 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  43.94 
 
 
209 aa  176  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  44.16 
 
 
207 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  43.5 
 
 
207 aa  175  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  44.16 
 
 
207 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  44.16 
 
 
207 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  43.15 
 
 
203 aa  175  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  45.36 
 
 
304 aa  175  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  42.42 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  43.78 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  46.39 
 
 
199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  45.23 
 
 
207 aa  171  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  43.15 
 
 
209 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  41.92 
 
 
209 aa  169  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  45.45 
 
 
217 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  43.59 
 
 
223 aa  168  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  46.46 
 
 
193 aa  168  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  45 
 
 
204 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  42.99 
 
 
211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  45.32 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_002620  TC0567  superoxide dismutase  41.41 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  45 
 
 
204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  43.9 
 
 
221 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  43.56 
 
 
221 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  43.56 
 
 
221 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  45.1 
 
 
233 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  45.1 
 
 
233 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  44.55 
 
 
192 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  44.55 
 
 
192 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  44.55 
 
 
192 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  44.55 
 
 
192 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  44.55 
 
 
192 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  43.88 
 
 
205 aa  159  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  42.65 
 
 
204 aa  158  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  42.5 
 
 
200 aa  158  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  39.51 
 
 
206 aa  158  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  44.06 
 
 
192 aa  157  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  44.06 
 
 
192 aa  157  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6857  Superoxide dismutase  40.28 
 
 
197 aa  157  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0552512 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  40.61 
 
 
225 aa  157  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  44.55 
 
 
192 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  43.37 
 
 
199 aa  157  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.140081 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  38.97 
 
 
223 aa  156  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  40.1 
 
 
203 aa  156  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  43 
 
 
192 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  42.5 
 
 
192 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  42.65 
 
 
201 aa  156  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3194  Superoxide dismutase  42.5 
 
 
192 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194093  normal  0.452704 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  42.72 
 
 
203 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  42.08 
 
 
204 aa  155  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  42.29 
 
 
203 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  41.75 
 
 
203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  43.22 
 
 
192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>