More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6201 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6201  manganese and iron superoxide dismutase  100 
 
 		 197 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2234  manganese and iron superoxide dismutase  66.5 
 
 		 205 aa  280  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6159  manganese and iron superoxide dismutase  65.99 
 
 		 204 aa  279  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7990  manganese and iron superoxide dismutase  67.02 
 
 		 205 aa  276  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  64.97 
 
 		 305 aa  274  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  64.8 
 
 		 302 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  65.28 
 
 		 308 aa  263  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2529  manganese and iron superoxide dismutase  66.31 
 
 		 197 aa  262  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.507658  normal  0.528937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2537  manganese and iron superoxide dismutase  64.21 
 
 		 224 aa  240  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4364  manganese and iron superoxide dismutase  51.32 
 
 		 203 aa  202  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0235641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1781  manganese and iron superoxide dismutase  51.55 
 
 		 239 aa  191  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1453  manganese and iron superoxide dismutase  38.25 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.46198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1158  superoxide dismutase  39.89 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000413259  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0840  manganese and iron superoxide dismutase  39.13 
 
 		 192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00121294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0956  superoxide dismutase  37.7 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2204  manganese and iron superoxide dismutase  38.46 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000605082  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_827  superoxide dismutase  37.84 
 
 		 192 aa  112  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0145605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2022  manganese and iron superoxide dismutase  37.91 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000363607 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2410  manganese and iron superoxide dismutase  38.8 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000430969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0075  Superoxide dismutase  33.33 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1258  Superoxide dismutase  34.2 
 
 		 244 aa  104  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.651957  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1927  manganese and iron superoxide dismutase  38.62 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.241942  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2012  manganese and iron superoxide dismutase  38.62 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1952  manganese and iron superoxide dismutase  38.1 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.777519  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  33.5 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  34 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1904  manganese and iron superoxide dismutase  35.98 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338856 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2101  manganese and iron superoxide dismutase  33.33 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  33.97 
 
 		 200 aa  89  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  33.88 
 
 		 226 aa  88.6  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  34.44 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  33.16 
 
 		 203 aa  86.3  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  33.7 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  32.83 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  32.32 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  29.44 
 
 		 304 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  29.44 
 
 		 304 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  29.44 
 
 		 304 aa  85.5  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  29.44 
 
 		 304 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  29.44 
 
 		 304 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  29.44 
 
 		 304 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  29.44 
 
 		 304 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1898  superoxide dismutase  31.58 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1574  manganese and iron superoxide dismutase  31.58 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011707 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  29.12 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  28.33 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  32.08 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0464  superoxide dismutase, manganese  31.72 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000102594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  28.33 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03794  superoxide dismutase, Mn  31.72 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5362  superoxide dismutase  31.72 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4440  superoxide dismutase  31.72 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03743  hypothetical protein  31.72 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4387  superoxide dismutase  31.72 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4076  Superoxide dismutase  31.18 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4138  superoxide dismutase  31.18 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  27.78 
 
 		 304 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4109  superoxide dismutase  31.18 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0081  superoxide dismutase  40.32 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4300  superoxide dismutase  31.18 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.928831  hitchhiker  0.00748774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4341  superoxide dismutase  31.15 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000961224 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4453  superoxide dismutase  31.15 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  27.78 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0072  Superoxide dismutase  35.38 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4301  superoxide dismutase  31.15 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4385  superoxide dismutase  31.15 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0287129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0056  Superoxide dismutase  34.62 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4272  superoxide dismutase  29.95 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.309361  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4063  superoxide dismutase  29.41 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  30 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  30.73 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  29.26 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  32.43 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0050  superoxide dismutase (Fe)  33.85 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.408378  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  29.67 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  30.77 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  28.49 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0365  superoxide dismutase (Fe)  23.23 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00134609  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  30.1 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  30.56 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  30.51 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  31.91 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00022  superoxide dismutase  38.98 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00410451  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  31.49 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  34.88 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  34.88 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  35.26 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  36.59 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3773  superoxide dismutase  34.38 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4160  superoxide dismutase  33.85 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4121  superoxide dismutase  34.38 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0035  superoxide dismutase  34.38 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  31.71 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  31.3 
 
 		 203 aa  74.3  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4442  superoxide dismutase  33.85 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  30.39 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  24.29 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3260  superoxide dismutase  30.36 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  30.15 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4533  superoxide dismutase  28.33 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.0274714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>