286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1574 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1898  superoxide dismutase  100 
 
 		 205 aa  424  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1574  manganese and iron superoxide dismutase  100 
 
 		 205 aa  424  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011707 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_827  superoxide dismutase  42.19 
 
 		 192 aa  178  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0145605  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0956  superoxide dismutase  44.2 
 
 		 192 aa  176  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0840  manganese and iron superoxide dismutase  42.11 
 
 		 192 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00121294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1158  superoxide dismutase  40.84 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000413259  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1904  manganese and iron superoxide dismutase  41.62 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338856 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2022  manganese and iron superoxide dismutase  38.66 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000363607 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2410  manganese and iron superoxide dismutase  39.27 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000430969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2204  manganese and iron superoxide dismutase  38.14 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000605082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1952  manganese and iron superoxide dismutase  41.62 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.777519  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2012  manganese and iron superoxide dismutase  41.12 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1927  manganese and iron superoxide dismutase  41.12 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.241942  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1453  manganese and iron superoxide dismutase  36.65 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.46198  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0075  Superoxide dismutase  35.35 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1258  Superoxide dismutase  34.54 
 
 		 244 aa  102  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.651957  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1781  manganese and iron superoxide dismutase  33.5 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6201  manganese and iron superoxide dismutase  31.58 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  31.05 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4364  manganese and iron superoxide dismutase  28.5 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0235641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  31.91 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  28.57 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  31.88 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2101  manganese and iron superoxide dismutase  29.23 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  32.54 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  30.2 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  27.46 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  33.14 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  28.08 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  28.71 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2529  manganese and iron superoxide dismutase  27.98 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.507658  normal  0.528937 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7990  manganese and iron superoxide dismutase  26.63 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0509196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  29.61 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  29.61 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  29.61 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  28.42 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  32.12 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  30.86 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2234  manganese and iron superoxide dismutase  27.57 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  28.16 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  26.83 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  26.83 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  27.55 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  29.07 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  31.18 
 
 		 299 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0214  superoxide dismutase  29.8 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  29.83 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6159  manganese and iron superoxide dismutase  26.49 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  28.48 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  28.74 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1292  Superoxide dismutase  29.67 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  30 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  27.81 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  26.11 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  32.39 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  30.24 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  26.42 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  24.86 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  32.95 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  25.44 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  25.88 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  27.11 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  33.6 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  26.63 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  28.32 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  28.65 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  29.7 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  28.4 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  28.03 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  26.42 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  33.52 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  27.27 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  25.58 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2537  manganese and iron superoxide dismutase  28.57 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  28.93 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  26.84 
 
 		 437 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  27.59 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  28.72 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  26.01 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  27.34 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  28.48 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  25.29 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0814  Superoxide dismutase  33.87 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.486373 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  33.33 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  26.19 
 
 		 348 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  26.51 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0032  superoxide dismutase(Fe)  31.25 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000179018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  26.11 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  25.6 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0050  superoxide dismutase (Fe)  32.58 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.408378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  25.15 
 
 		 304 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  25.15 
 
 		 304 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  25.15 
 
 		 304 aa  55.1  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  25.15 
 
 		 304 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  25.15 
 
 		 304 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  25.15 
 
 		 304 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  25.15 
 
 		 304 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  25 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  27.27 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63831  manganese-superoxide dismutase  27.84 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>