More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2529 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2529  manganese and iron superoxide dismutase  100 
 
 		 197 aa  410  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.507658  normal  0.528937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2234  manganese and iron superoxide dismutase  64.47 
 
 		 205 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7990  manganese and iron superoxide dismutase  64.92 
 
 		 205 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0509196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6159  manganese and iron superoxide dismutase  63.87 
 
 		 204 aa  266  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6201  manganese and iron superoxide dismutase  66.31 
 
 		 197 aa  262  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2537  manganese and iron superoxide dismutase  63.35 
 
 		 224 aa  250  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  61.5 
 
 		 305 aa  239  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  59.18 
 
 		 308 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  57.29 
 
 		 302 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4364  manganese and iron superoxide dismutase  46.11 
 
 		 203 aa  178  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0235641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1781  manganese and iron superoxide dismutase  42.19 
 
 		 239 aa  158  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_827  superoxide dismutase  35.71 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0145605  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0075  Superoxide dismutase  33.51 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2022  manganese and iron superoxide dismutase  35.36 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000363607 
 
 
-
 
NC_002936  DET0956  superoxide dismutase  34.24 
 
 		 192 aa  98.6  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2204  manganese and iron superoxide dismutase  34.25 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000605082  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  34.17 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1453  manganese and iron superoxide dismutase  34.27 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.46198  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1258  Superoxide dismutase  34.33 
 
 		 244 aa  95.5  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.651957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1158  superoxide dismutase  36.31 
 
 		 192 aa  95.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000413259  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0840  manganese and iron superoxide dismutase  34.25 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00121294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2410  manganese and iron superoxide dismutase  35.36 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000430969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  32.83 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  30.81 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  31.31 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  30.77 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  30.61 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  29.74 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  29.9 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  30 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1292  Superoxide dismutase  29.59 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  29.38 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  29.38 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  29.38 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  29.38 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  29.38 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  29.38 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  29.38 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  29.63 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  28.35 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  29.5 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  28.35 
 
 		 304 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  29.03 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  30.35 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0365  superoxide dismutase (Fe)  27.17 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00134609  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0214  superoxide dismutase  26.42 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  27.84 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  31.4 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  27.69 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  29.79 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1889  superoxide dismutase  27.59 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.61793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  27.98 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1251  Mn/Fe superoxide dismutase  27.5 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.275789  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  28.99 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  28.93 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  29.38 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  26.7 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  25.98 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  28.35 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03794  superoxide dismutase, Mn  29.95 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  29.38 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4440  superoxide dismutase  29.95 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03743  hypothetical protein  29.95 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  28.06 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2282  Superoxide dismutase  28.77 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1446  Mn/Fe superoxide dismutase  27 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.769471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5362  superoxide dismutase  29.95 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4387  superoxide dismutase  29.95 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4076  Superoxide dismutase  29.47 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  27.27 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1574  manganese and iron superoxide dismutase  27.98 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011707 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4138  superoxide dismutase  29.47 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  26.94 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1898  superoxide dismutase  27.98 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  30.89 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4109  superoxide dismutase  29.47 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  27.46 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  27 
 
 		 437 aa  72.4  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  26.8 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1129  superoxide dismutase  26.9 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0395543  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  27.18 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4300  superoxide dismutase  29.47 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.928831  hitchhiker  0.00748774 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  27.18 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  24.62 
 
 		 348 aa  72  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  30.05 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  26.11 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  27.32 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  30.35 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2101  manganese and iron superoxide dismutase  29.83 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  28.96 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4272  superoxide dismutase  29.86 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.309361  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4121  superoxide dismutase  28.17 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0035  superoxide dismutase  28.17 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3773  superoxide dismutase  28.17 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1927  manganese and iron superoxide dismutase  33.33 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.241942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  28.86 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0056  Superoxide dismutase  27.27 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  25.24 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4341  superoxide dismutase  29.86 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000961224 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  26.77 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>