More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2502 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  100 
 
 		 305 aa  623  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  63.58 
 
 		 302 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  58.75 
 
 		 308 aa  354  8.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6201  manganese and iron superoxide dismutase  64.97 
 
 		 197 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2234  manganese and iron superoxide dismutase  61.5 
 
 		 205 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7990  manganese and iron superoxide dismutase  61.5 
 
 		 205 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0509196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6159  manganese and iron superoxide dismutase  60.43 
 
 		 204 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2529  manganese and iron superoxide dismutase  61.5 
 
 		 197 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.507658  normal  0.528937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2537  manganese and iron superoxide dismutase  60.77 
 
 		 224 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4364  manganese and iron superoxide dismutase  50.26 
 
 		 203 aa  202  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0235641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1781  manganese and iron superoxide dismutase  48.19 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0956  superoxide dismutase  39.78 
 
 		 192 aa  116  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1453  manganese and iron superoxide dismutase  40.22 
 
 		 192 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.46198  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0840  manganese and iron superoxide dismutase  40.66 
 
 		 192 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00121294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2410  manganese and iron superoxide dismutase  40.21 
 
 		 192 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000430969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1158  superoxide dismutase  38.33 
 
 		 192 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000413259  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_827  superoxide dismutase  39.46 
 
 		 192 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0145605  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0075  Superoxide dismutase  33.99 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2204  manganese and iron superoxide dismutase  37.22 
 
 		 194 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000605082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2022  manganese and iron superoxide dismutase  37.78 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000363607 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1258  Superoxide dismutase  34.15 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.651957  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2101  manganese and iron superoxide dismutase  33.86 
 
 		 209 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  33 
 
 		 198 aa  93.2  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  31.09 
 
 		 348 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  32.5 
 
 		 437 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1904  manganese and iron superoxide dismutase  35.83 
 
 		 201 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338856 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  31.67 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  31.67 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  31.67 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  31.67 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  31.67 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  31.67 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  31.67 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  31.11 
 
 		 304 aa  89.4  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  31.11 
 
 		 304 aa  89  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  31.11 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  32.43 
 
 		 195 aa  87.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  29.79 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  32.67 
 
 		 205 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1927  manganese and iron superoxide dismutase  36.36 
 
 		 201 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.241942  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2012  manganese and iron superoxide dismutase  36.36 
 
 		 201 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  30.65 
 
 		 198 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1952  manganese and iron superoxide dismutase  36.36 
 
 		 201 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.777519  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  28.21 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  32.67 
 
 		 199 aa  85.9  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  33.16 
 
 		 226 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  32.85 
 
 		 200 aa  85.9  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  30.65 
 
 		 203 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  32.61 
 
 		 204 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  32.63 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1898  superoxide dismutase  31.05 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1574  manganese and iron superoxide dismutase  31.05 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011707 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  33.5 
 
 		 200 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  31.11 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2595  superoxide dismutase  30.09 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.765686  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  32.47 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  32.24 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  31.58 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  31.63 
 
 		 209 aa  81.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  32.6 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  32.78 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  33.33 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  31.32 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  29.5 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  34.29 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  31.72 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1251  Mn/Fe superoxide dismutase  29.7 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.275789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2676  Rhodanese domain protein  43.53 
 
 		 106 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  31.12 
 
 		 208 aa  78.6  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  37.4 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  32.16 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  42.53 
 
 		 113 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  32.12 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  29.67 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  33.9 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  36.59 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1292  Superoxide dismutase  29.8 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1129  superoxide dismutase  27.14 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0395543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  28.89 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  35.77 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2282  Superoxide dismutase  39.2 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  38.76 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  30.65 
 
 		 207 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  36.3 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0365  superoxide dismutase (Fe)  28.43 
 
 		 214 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00134609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  29.69 
 
 		 223 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  36.15 
 
 		 207 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  36.15 
 
 		 207 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  36.15 
 
 		 207 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  29.59 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  35.77 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1446  Mn/Fe superoxide dismutase  28.79 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.769471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  29.02 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3260  superoxide dismutase  29.95 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00022  superoxide dismutase  30.46 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00410451  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  29.28 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0976  superoxide dismutase  29.74 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  29.9 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2669  Superoxide dismutase  35.34 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.804084  normal  0.155291 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  31.66 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>