More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1258 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1258  Superoxide dismutase  100 
 
 
244 aa  503  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.651957  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0075  Superoxide dismutase  70.65 
 
 
207 aa  294  7e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2101  manganese and iron superoxide dismutase  37.89 
 
 
209 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1781  manganese and iron superoxide dismutase  34.65 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202086  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1904  manganese and iron superoxide dismutase  36.36 
 
 
201 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0338856 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1952  manganese and iron superoxide dismutase  36.18 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.777519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1158  superoxide dismutase  36.04 
 
 
192 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000413259  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1927  manganese and iron superoxide dismutase  36.87 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.241942  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2012  manganese and iron superoxide dismutase  36.87 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  28.1 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  37.23 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  33.51 
 
 
204 aa  109  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  32.28 
 
 
299 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  33.7 
 
 
214 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  34.15 
 
 
305 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  32.97 
 
 
200 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  33.51 
 
 
205 aa  105  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  32.79 
 
 
198 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  37.77 
 
 
206 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6201  manganese and iron superoxide dismutase  34.2 
 
 
197 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555386 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4364  manganese and iron superoxide dismutase  34.65 
 
 
203 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0235641  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  32.47 
 
 
199 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  32.79 
 
 
207 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  29.1 
 
 
202 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_002936  DET0956  superoxide dismutase  36.17 
 
 
192 aa  102  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1574  manganese and iron superoxide dismutase  34.54 
 
 
205 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  30.51 
 
 
209 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1898  superoxide dismutase  34.54 
 
 
205 aa  102  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2410  manganese and iron superoxide dismutase  33.5 
 
 
192 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000430969  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1453  manganese and iron superoxide dismutase  32.99 
 
 
192 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.46198  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  32.09 
 
 
207 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_827  superoxide dismutase  35.75 
 
 
192 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0145605  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  33.15 
 
 
195 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  31.38 
 
 
204 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  33.7 
 
 
207 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  32.67 
 
 
308 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  32.24 
 
 
209 aa  99.8  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  32.24 
 
 
209 aa  99.4  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0840  manganese and iron superoxide dismutase  35.05 
 
 
192 aa  99  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00121294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2022  manganese and iron superoxide dismutase  31.82 
 
 
194 aa  98.6  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000363607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  30 
 
 
198 aa  98.6  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  37.23 
 
 
205 aa  98.6  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  32.97 
 
 
209 aa  98.2  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  34.38 
 
 
200 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  33.7 
 
 
207 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2204  manganese and iron superoxide dismutase  31.31 
 
 
194 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000605082  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  34.38 
 
 
203 aa  97.4  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  33.68 
 
 
200 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  34.9 
 
 
203 aa  96.7  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  33.5 
 
 
302 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  32.24 
 
 
208 aa  96.3  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7990  manganese and iron superoxide dismutase  32.62 
 
 
205 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  32.02 
 
 
203 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2529  manganese and iron superoxide dismutase  34.33 
 
 
197 aa  95.5  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.507658  normal  0.528937 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  33.15 
 
 
206 aa  95.5  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  32.09 
 
 
209 aa  95.5  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  31.49 
 
 
203 aa  95.5  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  27.49 
 
 
226 aa  95.1  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  30.05 
 
 
197 aa  95.1  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  34.02 
 
 
200 aa  95.1  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2234  manganese and iron superoxide dismutase  32.62 
 
 
205 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1705  superoxide dismutase  34.52 
 
 
205 aa  94.7  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6159  manganese and iron superoxide dismutase  32.45 
 
 
204 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  33.33 
 
 
200 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  33.16 
 
 
211 aa  94  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  30.85 
 
 
203 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  30.43 
 
 
208 aa  92.8  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  33.7 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_002620  TC0567  superoxide dismutase  33.15 
 
 
207 aa  92  8e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  32.58 
 
 
199 aa  91.7  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  32.77 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  29.95 
 
 
437 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  31.52 
 
 
207 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  32.63 
 
 
211 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  31.52 
 
 
207 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  30.43 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  31.52 
 
 
207 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2537  manganese and iron superoxide dismutase  32.62 
 
 
224 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31067  Mn-Superoxide dismutase  30.81 
 
 
224 aa  89.7  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.076255  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  31.58 
 
 
209 aa  88.6  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  28.43 
 
 
348 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1986  Superoxide dismutase  27.09 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  29.73 
 
 
208 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  29.5 
 
 
203 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  29.41 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  26.98 
 
 
217 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  31.34 
 
 
209 aa  87  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1251  Mn/Fe superoxide dismutase  30.33 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.275789  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  31.84 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  27.62 
 
 
304 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  27.62 
 
 
304 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  27.62 
 
 
304 aa  86.3  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  27.62 
 
 
304 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  27.62 
 
 
304 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  29.65 
 
 
206 aa  86.3  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  27.62 
 
 
304 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  27.62 
 
 
304 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  32.76 
 
 
207 aa  85.9  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  31.4 
 
 
209 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  30.85 
 
 
204 aa  85.5  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>