More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1158 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1158  superoxide dismutase  100 
 
 		 192 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000413259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2410  manganese and iron superoxide dismutase  89.06 
 
 		 192 aa  358  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000430969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1453  manganese and iron superoxide dismutase  81.77 
 
 		 192 aa  333  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.46198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2204  manganese and iron superoxide dismutase  67.54 
 
 		 194 aa  293  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000605082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2022  manganese and iron superoxide dismutase  67.02 
 
 		 194 aa  290  9e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000363607 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_827  superoxide dismutase  64.74 
 
 		 192 aa  274  5e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0145605  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0956  superoxide dismutase  64.21 
 
 		 192 aa  271  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0840  manganese and iron superoxide dismutase  63.49 
 
 		 192 aa  266  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00121294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1904  manganese and iron superoxide dismutase  45.88 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338856 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1952  manganese and iron superoxide dismutase  45.36 
 
 		 201 aa  171  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.777519  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1927  manganese and iron superoxide dismutase  45.36 
 
 		 201 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.241942  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2012  manganese and iron superoxide dismutase  45.36 
 
 		 201 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1898  superoxide dismutase  40.84 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1574  manganese and iron superoxide dismutase  40.84 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011707 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2101  manganese and iron superoxide dismutase  41.85 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4364  manganese and iron superoxide dismutase  39.34 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0235641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  38.33 
 
 		 305 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6201  manganese and iron superoxide dismutase  39.89 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555386 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1258  Superoxide dismutase  36.04 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.651957  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1781  manganese and iron superoxide dismutase  35.87 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0075  Superoxide dismutase  34.34 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  38.24 
 
 		 206 aa  104  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  37.63 
 
 		 302 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  39.34 
 
 		 308 aa  101  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  37.04 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  34.04 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  32.98 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  32.99 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  32.49 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2537  manganese and iron superoxide dismutase  37.7 
 
 		 224 aa  95.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2529  manganese and iron superoxide dismutase  36.31 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.507658  normal  0.528937 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1292  Superoxide dismutase  35.12 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  36.31 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  33.52 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  35.16 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  34.71 
 
 		 200 aa  91.7  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  31.95 
 
 		 209 aa  91.3  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7990  manganese and iron superoxide dismutase  35.16 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0509196  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  31.61 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  33.53 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  33.14 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  34.07 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4203  Superoxide dismutase  35.96 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2234  manganese and iron superoxide dismutase  34.62 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  34.07 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  34.07 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  34.07 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  34.07 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  34.07 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  34.07 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  34.07 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  34.07 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  31.64 
 
 		 203 aa  88.6  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  35.5 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  34.5 
 
 		 203 aa  87.8  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  38.93 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  32.2 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  30.93 
 
 		 208 aa  85.9  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  31.64 
 
 		 198 aa  85.5  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  29.71 
 
 		 202 aa  85.1  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  30.06 
 
 		 200 aa  85.1  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1889  superoxide dismutase  32.54 
 
 		 210 aa  85.1  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.61793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  33.71 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  33.52 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  30.99 
 
 		 207 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  33.52 
 
 		 192 aa  84.3  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0214  superoxide dismutase  32.34 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  41.82 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  32.35 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  28.82 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  32.58 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  30.51 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6159  manganese and iron superoxide dismutase  34.08 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  34.32 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  32.35 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  45.13 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  32.1 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  45.13 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  29.44 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0814  Superoxide dismutase  39.34 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.486373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  34.44 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1251  Mn/Fe superoxide dismutase  35.23 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.275789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  30.59 
 
 		 299 aa  81.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  28.82 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  29.59 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  29.59 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  29.59 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  31.46 
 
 		 226 aa  81.3  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1446  Mn/Fe superoxide dismutase  34.46 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.769471  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  32.65 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  28.65 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  30 
 
 		 437 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3237  superoxide dismutase  31.46 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  30.68 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  28.24 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  29.71 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  32.54 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  31.58 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  29.21 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  29.65 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>