More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7990 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7990  manganese and iron superoxide dismutase  100 
 
 		 205 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0509196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2234  manganese and iron superoxide dismutase  94.15 
 
 		 205 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6159  manganese and iron superoxide dismutase  85.85 
 
 		 204 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6201  manganese and iron superoxide dismutase  67.02 
 
 		 197 aa  276  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2529  manganese and iron superoxide dismutase  64.92 
 
 		 197 aa  273  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.507658  normal  0.528937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2537  manganese and iron superoxide dismutase  63.73 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  63.64 
 
 		 308 aa  245  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  61.5 
 
 		 305 aa  244  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  59.46 
 
 		 302 aa  231  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4364  manganese and iron superoxide dismutase  47.59 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0235641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1781  manganese and iron superoxide dismutase  47.83 
 
 		 239 aa  175  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0840  manganese and iron superoxide dismutase  36.41 
 
 		 192 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00121294  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0075  Superoxide dismutase  31.18 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1453  manganese and iron superoxide dismutase  38.69 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.46198  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0956  superoxide dismutase  34.25 
 
 		 192 aa  99  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_827  superoxide dismutase  33.88 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0145605  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1258  Superoxide dismutase  32.62 
 
 		 244 aa  95.5  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.651957  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1927  manganese and iron superoxide dismutase  35.33 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.241942  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2012  manganese and iron superoxide dismutase  35.33 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2022  manganese and iron superoxide dismutase  35.11 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000363607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1952  manganese and iron superoxide dismutase  34.78 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.777519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2204  manganese and iron superoxide dismutase  34.04 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000605082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1158  superoxide dismutase  35.16 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000413259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2410  manganese and iron superoxide dismutase  36.11 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000430969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  32.99 
 
 		 199 aa  88.6  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1904  manganese and iron superoxide dismutase  32.61 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338856 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  32.47 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  32.66 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  31.16 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  28.65 
 
 		 437 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  27.05 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  28.78 
 
 		 226 aa  77.8  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  26.37 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  29.05 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  33.33 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  29.32 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  28.78 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  30.11 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  28.1 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  25.79 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  25.63 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  28.57 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  24.73 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  24.19 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  27.23 
 
 		 299 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  27.51 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  24.19 
 
 		 304 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  26.02 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2101  manganese and iron superoxide dismutase  31.03 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  25.81 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  25.81 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  25.81 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  25.81 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  25.81 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  25.81 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  25.81 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  28.11 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  29.41 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  29.84 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  26.7 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  25.42 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  29.21 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1898  superoxide dismutase  26.63 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1574  manganese and iron superoxide dismutase  26.63 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011707 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  29.14 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  27.78 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  29.12 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  26.9 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  26.87 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  26.18 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1292  Superoxide dismutase  27.64 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  25.79 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  32 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  28.19 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  31.22 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1251  Mn/Fe superoxide dismutase  32.77 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.275789  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  26.21 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  27.78 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  25.29 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  28.74 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1446  Mn/Fe superoxide dismutase  31.93 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.769471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2595  superoxide dismutase  31.71 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.765686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  23.65 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  30.58 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  26.55 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  25.68 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  24.49 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1129  superoxide dismutase  26.92 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0395543  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1312  superoxide dismutase (Fe)  28.36 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000018669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  26.63 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1320  Superoxide dismutase  28.02 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  30.58 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  25.99 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0365  superoxide dismutase (Fe)  23.78 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00134609  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  27.27 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  26.57 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2693  Fe/Mn family superoxide dismutase  30.46 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1645  superoxide dismutase  27.62 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159138  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1611  superoxide dismutase  27.62 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.308425  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1350  superoxide dismutase  30.46 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.772755  normal  0.0350639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>