More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1781 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1781  manganese and iron superoxide dismutase  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4364  manganese and iron superoxide dismutase  54.45 
 
 		 203 aa  227  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0235641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6201  manganese and iron superoxide dismutase  51.55 
 
 		 197 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  48.19 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2234  manganese and iron superoxide dismutase  47.59 
 
 		 205 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7990  manganese and iron superoxide dismutase  47.06 
 
 		 205 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  49.74 
 
 		 302 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  47.94 
 
 		 308 aa  171  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6159  manganese and iron superoxide dismutase  46.2 
 
 		 204 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2537  manganese and iron superoxide dismutase  47.85 
 
 		 224 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2529  manganese and iron superoxide dismutase  42.19 
 
 		 197 aa  158  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.507658  normal  0.528937 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1258  Superoxide dismutase  31.84 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.651957  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0956  superoxide dismutase  35.16 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0840  manganese and iron superoxide dismutase  36.46 
 
 		 192 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00121294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1158  superoxide dismutase  35.87 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000413259  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_827  superoxide dismutase  33.33 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0145605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2101  manganese and iron superoxide dismutase  33.33 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2410  manganese and iron superoxide dismutase  35.33 
 
 		 192 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000430969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1453  manganese and iron superoxide dismutase  32.79 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.46198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2204  manganese and iron superoxide dismutase  32.09 
 
 		 194 aa  95.9  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000605082  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0075  Superoxide dismutase  30.54 
 
 		 207 aa  96.3  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2012  manganese and iron superoxide dismutase  35.79 
 
 		 201 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1927  manganese and iron superoxide dismutase  35.79 
 
 		 201 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.241942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1904  manganese and iron superoxide dismutase  33.67 
 
 		 201 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338856 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2022  manganese and iron superoxide dismutase  32.09 
 
 		 194 aa  95.1  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000363607 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  32.79 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  32.24 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1952  manganese and iron superoxide dismutase  34.74 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.777519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1574  manganese and iron superoxide dismutase  33.5 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1898  superoxide dismutase  33.5 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  32.24 
 
 		 200 aa  90.9  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  31.15 
 
 		 200 aa  90.1  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  30.05 
 
 		 200 aa  85.1  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  32.24 
 
 		 200 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  31.87 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  31.31 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  31.69 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  31.89 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  31.15 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  30.6 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  30.94 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  31.5 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  30.6 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  30.85 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  32.42 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  29.95 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  32.24 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  29.12 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  27.37 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  29.21 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  32.04 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0365  superoxide dismutase (Fe)  27.66 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00134609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  30.81 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  33.13 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  33.13 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  33.13 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  28.22 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  29.28 
 
 		 204 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  30.16 
 
 		 208 aa  72  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  30.98 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  27.53 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  29.8 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  29.57 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  31.4 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  26.02 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0032  superoxide dismutase(Fe)  28.28 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000179018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  24.32 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  24.32 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  24.32 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  24.32 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  24.32 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  24.32 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  24.32 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0729  superoxide dismutase  26.55 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  28 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  29.12 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  26.92 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  29.67 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  28.29 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1312  superoxide dismutase (Fe)  30.08 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000018669  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  31.38 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  30.81 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  31.9 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  24.86 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  27.63 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  29.83 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4203  Superoxide dismutase  31.2 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  25 
 
 		 348 aa  65.5  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  24.86 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  28.81 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  27.15 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1292  Superoxide dismutase  27.55 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0164  superoxide dismutase, Fe  27.78 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  24.86 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  25.95 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  27.33 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  27.78 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  27.17 
 
 		 200 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0205  superoxide dismutase, Fe  27.78 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.570423  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  25.14 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>