More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6159 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6159  manganese and iron superoxide dismutase  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2234  manganese and iron superoxide dismutase  85.37 
 
 		 205 aa  367  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7990  manganese and iron superoxide dismutase  85.85 
 
 		 205 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6201  manganese and iron superoxide dismutase  65.99 
 
 		 197 aa  279  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2529  manganese and iron superoxide dismutase  63.87 
 
 		 197 aa  266  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.507658  normal  0.528937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  60.43 
 
 		 305 aa  241  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2537  manganese and iron superoxide dismutase  61.66 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  60 
 
 		 308 aa  235  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  57.73 
 
 		 302 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4364  manganese and iron superoxide dismutase  46.96 
 
 		 203 aa  178  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0235641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1781  manganese and iron superoxide dismutase  46.2 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0840  manganese and iron superoxide dismutase  36.07 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00121294  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0075  Superoxide dismutase  30.11 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0956  superoxide dismutase  34.62 
 
 		 192 aa  95.9  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1258  Superoxide dismutase  32.45 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.651957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1453  manganese and iron superoxide dismutase  35.03 
 
 		 192 aa  92.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.46198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_827  superoxide dismutase  33.33 
 
 		 192 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0145605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1927  manganese and iron superoxide dismutase  35.56 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.241942  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2012  manganese and iron superoxide dismutase  35.56 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2410  manganese and iron superoxide dismutase  34.27 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000430969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1952  manganese and iron superoxide dismutase  35.56 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.777519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2022  manganese and iron superoxide dismutase  34.04 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000363607 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2204  manganese and iron superoxide dismutase  32.98 
 
 		 194 aa  87  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000605082  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1650  manganese and iron superoxide dismutase  33.66 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.140081 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2515  manganese and iron superoxide dismutase  33.17 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.24618  normal  0.282222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1904  manganese and iron superoxide dismutase  33.89 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338856 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1158  superoxide dismutase  34.08 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000413259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  29.67 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  25.99 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  25.99 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  25.99 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  25.99 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  25.99 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  25.99 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  25.99 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  29.41 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0365  superoxide dismutase (Fe)  25.76 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00134609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  28.65 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  27.84 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  27.98 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  24.29 
 
 		 304 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  24.29 
 
 		 304 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2101  manganese and iron superoxide dismutase  29.89 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  24.86 
 
 		 304 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3234  Superoxide dismutase  29.15 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  29.59 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  28.21 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  25.42 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2522  Superoxide dismutase  29.65 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  26.53 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  27.12 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  28.57 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  23.73 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  25.84 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  28.81 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2542  Superoxide dismutase  30.35 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.796981  normal  0.230493 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0032  superoxide dismutase(Fe)  26.78 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000179018  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2178  Superoxide dismutase  28.43 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799015  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  25.14 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  25.64 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  26.53 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1292  Superoxide dismutase  27.14 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1129  superoxide dismutase  26.82 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0395543  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0456  Superoxide dismutase  28.14 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  25.14 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2595  superoxide dismutase  31.45 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.765686  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  26.94 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  27.5 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  24.26 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  27.03 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1574  manganese and iron superoxide dismutase  26.49 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011707 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2693  Fe/Mn family superoxide dismutase  30.96 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  28.99 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1898  superoxide dismutase  26.49 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1251  Mn/Fe superoxide dismutase  31.93 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.275789  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  28.33 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1350  superoxide dismutase  30.96 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.772755  normal  0.0350639 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  28.87 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  25.91 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  25.84 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1312  superoxide dismutase (Fe)  25.93 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000018669  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1446  Mn/Fe superoxide dismutase  31.09 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.769471  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2880  Superoxide dismutase  30.29 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  24.71 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0976  superoxide dismutase  30.61 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1889  superoxide dismutase  27.93 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.61793 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  27.59 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1067  superoxide dismutase  31.47 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  26.6 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00022  superoxide dismutase  33.08 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00410451  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  28.33 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  35.43 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1871  superoxide dismutase  30.96 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.441148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  26.29 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0328  superoxide dismutase (Fe)  25.91 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.731602  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0081  superoxide dismutase  31.78 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  25.63 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  23.08 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  23.32 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  32.71 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>