More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1446 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1446  Mn/Fe superoxide dismutase  100 
 
 		 227 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.769471  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1251  Mn/Fe superoxide dismutase  98.24 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.275789  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1628  Superoxide dismutase  55.84 
 
 		 201 aa  238  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3237  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 201 aa  235  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  54.04 
 
 		 204 aa  233  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  53.54 
 
 		 209 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3725  superoxide dismutase  53.54 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  hitchhiker  0.00168961 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  55.05 
 
 		 204 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0762  superoxide dismutase (Mn)  54.64 
 
 		 201 aa  226  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0276674  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  53.27 
 
 		 204 aa  225  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  53.06 
 
 		 204 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  51.55 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2152  Superoxide dismutase  51.78 
 
 		 201 aa  221  7e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0622589 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2494  Superoxide dismutase  51.01 
 
 		 204 aa  221  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  52.6 
 
 		 203 aa  220  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  51.53 
 
 		 203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0704  superoxide dismutase  49.49 
 
 		 200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  50.51 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  50.51 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  50.51 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  50.51 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  50.51 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  50.51 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  50.51 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  50.51 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  51.02 
 
 		 203 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  46.26 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  50 
 
 		 203 aa  216  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  50 
 
 		 203 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0749  superoxide dismutase  47.39 
 
 		 240 aa  215  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  47.55 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2282  Superoxide dismutase  49.01 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  47.8 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  47.8 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  48.74 
 
 		 203 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  47.72 
 
 		 205 aa  206  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  48.99 
 
 		 199 aa  205  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  46.46 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1235  Superoxide dismutase  49.75 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  46.19 
 
 		 261 aa  202  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  47.18 
 
 		 204 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0788  superoxide dismutase, Fe-Mn  51.03 
 
 		 202 aa  201  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.319685  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  49.01 
 
 		 203 aa  201  8e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0458  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 206 aa  201  9e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4533  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.0274714 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  50 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  47.69 
 
 		 203 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0056  Superoxide dismutase  48.02 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1611  superoxide dismutase  46.97 
 
 		 199 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.308425  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1645  superoxide dismutase  46.97 
 
 		 199 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2669  Superoxide dismutase  45.96 
 
 		 203 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.804084  normal  0.155291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  48.51 
 
 		 201 aa  197  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3014  Superoxide dismutase  41.86 
 
 		 268 aa  197  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0072  Superoxide dismutase  47.03 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0124  superoxide dismutase  48.73 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00649836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0119  superoxide dismutase  48.73 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000118363  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4160  superoxide dismutase  47.03 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3962  superoxide dismutase  46.7 
 
 		 208 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5571  superoxide dismutase, Mn  45.69 
 
 		 208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  49.01 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4442  superoxide dismutase  47.03 
 
 		 208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5395  Superoxide dismutase  45.54 
 
 		 204 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5300  superoxide dismutase, Mn  45.69 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5142  superoxide dismutase, manganese  45.69 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0516387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  44.67 
 
 		 203 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5696  superoxide dismutase, Mn  45.69 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5378  superoxide dismutase, Mn  45.69 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000859451  normal  0.033463 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5541  superoxide dismutase, Mn  45.69 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5627  superoxide dismutase, Mn  45.69 
 
 		 208 aa  194  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5579  superoxide dismutase, Mn  45.69 
 
 		 208 aa  194  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5127  superoxide dismutase, manganese  45.69 
 
 		 208 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  47.26 
 
 		 202 aa  194  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7449  manganese and iron superoxide dismutase  43.88 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5239  superoxide dismutase  45.69 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  44.95 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0985  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0607  superoxide dismutase  45.92 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.996807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0946  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  45.13 
 
 		 203 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3773  superoxide dismutase  45.05 
 
 		 207 aa  191  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4121  superoxide dismutase  45.05 
 
 		 207 aa  191  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0035  superoxide dismutase  45.05 
 
 		 207 aa  191  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0485  twin-arginine translocation pathway signal  44.9 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.7715  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1897  Superoxide dismutase  40.69 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  47.5 
 
 		 206 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  45.64 
 
 		 203 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  44.61 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2662  superoxide dismutase  45.05 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00481875  normal  0.116987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  46.97 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0230  hypothetical protein  47.32 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.823179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2906  Superoxide dismutase  45.25 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4459  superoxide dismutase, Mn  45.18 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4586  superoxide dismutase  43.9 
 
 		 211 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4203  Superoxide dismutase  45.05 
 
 		 201 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3260  superoxide dismutase  45.41 
 
 		 203 aa  185  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0237  superoxide dismutase  46.04 
 
 		 203 aa  184  7e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000011486  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4063  superoxide dismutase  44.55 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0205  superoxide dismutase  42.47 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0562939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4387  superoxide dismutase  45.05 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4440  superoxide dismutase  45.05 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>