More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2906 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2906  Superoxide dismutase  100 
 
 		 240 aa  492  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  66.33 
 
 		 201 aa  290  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1601  Superoxide dismutase  57.98 
 
 		 231 aa  289  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  65.33 
 
 		 201 aa  279  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  63.54 
 
 		 209 aa  275  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1748  Superoxide dismutase  61.5 
 
 		 202 aa  273  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0237  superoxide dismutase  62.5 
 
 		 203 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000011486  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5395  Superoxide dismutase  59 
 
 		 204 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4203  Superoxide dismutase  60.1 
 
 		 201 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  59.09 
 
 		 200 aa  261  4.999999999999999e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1103  superoxide dismutase  61 
 
 		 202 aa  260  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.780298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  58.71 
 
 		 212 aa  247  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0814  Superoxide dismutase  58.16 
 
 		 246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.486373 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  60.82 
 
 		 201 aa  245  6e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  56.37 
 
 		 204 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  58.21 
 
 		 203 aa  243  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  54.63 
 
 		 204 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1897  Superoxide dismutase  60.31 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1320  Superoxide dismutase  53.78 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002217  manganese superoxide dismutase  54.4 
 
 		 202 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.378947  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2266  superoxide dismutase, Mn  52.53 
 
 		 222 aa  235  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000301489  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  55.84 
 
 		 199 aa  234  7e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1611  superoxide dismutase  56.35 
 
 		 199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.308425  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1645  superoxide dismutase  56.35 
 
 		 199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  55.28 
 
 		 203 aa  231  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  55.28 
 
 		 203 aa  231  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  53.92 
 
 		 204 aa  231  6e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  55.28 
 
 		 203 aa  231  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4152  superoxide dismutase  55.88 
 
 		 203 aa  231  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  55.28 
 
 		 203 aa  231  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  55.28 
 
 		 203 aa  231  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  55.28 
 
 		 203 aa  231  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  55.28 
 
 		 203 aa  231  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  55.28 
 
 		 203 aa  231  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  55.28 
 
 		 203 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  54.9 
 
 		 209 aa  231  9e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1628  Superoxide dismutase  57.43 
 
 		 201 aa  230  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3359  Superoxide dismutase  54.9 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000950604  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  55.28 
 
 		 204 aa  230  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00151  manganese superoxide dismutase  51.81 
 
 		 202 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  53.77 
 
 		 203 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3237  superoxide dismutase  54.68 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  56.72 
 
 		 203 aa  229  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3725  superoxide dismutase  55.22 
 
 		 201 aa  228  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  hitchhiker  0.00168961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0704  superoxide dismutase  54.95 
 
 		 200 aa  228  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2494  Superoxide dismutase  55.61 
 
 		 204 aa  228  7e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  56.35 
 
 		 203 aa  228  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  53.5 
 
 		 202 aa  227  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2152  Superoxide dismutase  54.95 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0622589 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1046  superoxide dismutase  50.95 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675298  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0923  superoxide dismutase  50.95 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.790701  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0124  superoxide dismutase  53.69 
 
 		 199 aa  224  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00649836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0119  superoxide dismutase  53.69 
 
 		 199 aa  224  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000118363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  54.63 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0230  hypothetical protein  49.25 
 
 		 205 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.823179 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00022  superoxide dismutase  55.1 
 
 		 235 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00410451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0851  manganese and iron superoxide dismutase  54.68 
 
 		 203 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  55.17 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  51.47 
 
 		 203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0081  superoxide dismutase  58.25 
 
 		 206 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4063  superoxide dismutase  57.22 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  51.98 
 
 		 201 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  52.74 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4586  superoxide dismutase  56.31 
 
 		 211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3014  Superoxide dismutase  49.29 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  50.98 
 
 		 204 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  52.45 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4459  superoxide dismutase, Mn  54.55 
 
 		 203 aa  214  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4160  superoxide dismutase  55.94 
 
 		 208 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  54.69 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  52.48 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  47.06 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0035  superoxide dismutase  55.45 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0386  superoxide dismutase  51.23 
 
 		 204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0447304  normal  0.747041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4121  superoxide dismutase  55.45 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  51.5 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3773  superoxide dismutase  55.45 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  54.77 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  55.38 
 
 		 193 aa  212  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  43.9 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  43.9 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4442  superoxide dismutase  55.45 
 
 		 208 aa  211  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  54.23 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  54.23 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  47.12 
 
 		 270 aa  211  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2092  superoxide dismutase  51.98 
 
 		 203 aa  211  7e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.28346  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4453  superoxide dismutase  55.67 
 
 		 206 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4341  superoxide dismutase  55.67 
 
 		 206 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000961224 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4385  superoxide dismutase  55.67 
 
 		 206 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0287129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4301  superoxide dismutase  55.67 
 
 		 206 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0953  superoxide dismutase  50.49 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03794  superoxide dismutase, Mn  55.15 
 
 		 206 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4387  superoxide dismutase  55.15 
 
 		 206 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5362  superoxide dismutase  55.15 
 
 		 206 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2669  Superoxide dismutase  51.52 
 
 		 203 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.804084  normal  0.155291 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4272  superoxide dismutase  55.67 
 
 		 206 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.309361  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03743  hypothetical protein  55.15 
 
 		 206 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4440  superoxide dismutase  55.15 
 
 		 206 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  50.98 
 
 		 203 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0762  superoxide dismutase (Mn)  53.77 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0276674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>