100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6200 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  100 
 
 		 113 aa  235  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2246  rhodanese domain-containing protein  45.24 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00449361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  50.67 
 
 		 302 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  42.53 
 
 		 305 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  42.68 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2448  rhodanese-like protein  38.18 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2676  Rhodanese domain protein  37.37 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2657  rhodanese-like protein  38.37 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4887  hypothetical protein  40.86 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  37.25 
 
 		 276 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  35.78 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  35.78 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2390  Rhodanese domain protein  35.79 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  36.7 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4735  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 		 276 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  39.81 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1047  Rhodanese domain protein  30.93 
 
 		 185 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  36.59 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1890  Rhodanese domain protein  29.25 
 
 		 276 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4664  hypothetical protein  39.77 
 
 		 272 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  39.29 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6163  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 276 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4195  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 276 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3650  rhodanese domain-containing protein  31.96 
 
 		 273 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2725  Rhodanese domain protein  36.9 
 
 		 271 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  36.9 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  32.18 
 
 		 328 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2238  Rhodanese domain protein  32.69 
 
 		 276 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50226  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  37.78 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  37.66 
 
 		 106 aa  47.4  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  37.08 
 
 		 116 aa  47.4  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  37.97 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  36.59 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6096  Rhodanese domain protein  31.73 
 
 		 276 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0021  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 223 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.45235  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  33.77 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  36.36 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  34.78 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  34.57 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  35.53 
 
 		 245 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  37.66 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  34 
 
 		 263 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  32.53 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0707  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  35.87 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  35.87 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1756  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0147  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.123976  normal  0.0555089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  37.66 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  33.77 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  32.47 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  37.18 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0299  Rhodanese domain protein  34.83 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248369 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  31.58 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  32.29 
 
 		 277 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  31.52 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2384  tRNA 2-selenouridine synthase  44.68 
 
 		 345 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.55321e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  34.94 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  31.52 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3629  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.18 
 
 		 557 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  31.71 
 
 		 102 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0928  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 223 aa  41.2  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  36.14 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  33.77 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  33.77 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0410  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.692094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  33.77 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  34.78 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2084  tRNA 2-selenouridine synthase  33.33 
 
 		 359 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  30.3 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1512  rhodanese domain-containing protein  34.41 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.766741  normal  0.549953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 		 460 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3301  tRNA 2-selenouridine synthase  44.19 
 
 		 353 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  31.52 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  32.05 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  51.02 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  35.06 
 
 		 110 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  27.59 
 
 		 137 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  37.04 
 
 		 254 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>