More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00135 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  100 
 
 		 328 aa  637    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  53.31 
 
 		 330 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  53.61 
 
 		 330 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  53.65 
 
 		 331 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  51.67 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  51.67 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  51.67 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  53.82 
 
 		 329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  51.67 
 
 		 330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  51.67 
 
 		 330 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  52.53 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  52.68 
 
 		 330 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  52.68 
 
 		 330 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  52.68 
 
 		 330 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  52.68 
 
 		 330 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  52.68 
 
 		 330 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  52.68 
 
 		 330 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  52.68 
 
 		 330 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  51.06 
 
 		 331 aa  298  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  48.31 
 
 		 334 aa  286  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  46.82 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  50.17 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  43.35 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  43.35 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  43.55 
 
 		 334 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  43.17 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  41.02 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  40.52 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  39.69 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  43.77 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  42.04 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  37.1 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  38.11 
 
 		 351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  37.38 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  36.96 
 
 		 341 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  36.96 
 
 		 348 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  36.96 
 
 		 348 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  37.38 
 
 		 349 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  36.3 
 
 		 373 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  41.11 
 
 		 311 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  35.64 
 
 		 362 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  41.26 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  33.23 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  33.66 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  38.31 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  33.87 
 
 		 346 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  33.87 
 
 		 348 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  33.87 
 
 		 381 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  33.87 
 
 		 362 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  33.87 
 
 		 381 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  33.87 
 
 		 362 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  33.87 
 
 		 362 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  34.82 
 
 		 345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  34.54 
 
 		 332 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  32.6 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  26.6 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  30.48 
 
 		 206 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  29.35 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  30.43 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  28.48 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  29.89 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  27.22 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  32.99 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  29.17 
 
 		 227 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0726  SNARE associated Golgi protein  27.81 
 
 		 213 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.19 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  30.86 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0201  SNARE associated Golgi protein  24.74 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  28.8 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  28.07 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  29.5 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  32.74 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  33.65 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  30.5 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  27.75 
 
 		 247 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  30.97 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  26.14 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  30.85 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  31.61 
 
 		 197 aa  55.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.64 
 
 		 458 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  31.61 
 
 		 172 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  30.49 
 
 		 220 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  30.49 
 
 		 220 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  31.48 
 
 		 122 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  30.49 
 
 		 220 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0604  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.65 
 
 		 194 aa  54.3  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00110976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1013  rhodanese-like protein  32.05 
 
 		 133 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  24.06 
 
 		 203 aa  54.3  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  31.76 
 
 		 211 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4141  hypothetical protein  28.74 
 
 		 220 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.754681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  39.42 
 
 		 461 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4272  SNARE associated Golgi protein  28.74 
 
 		 220 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1047  Rhodanese domain protein  40.82 
 
 		 185 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  26.32 
 
 		 217 aa  53.5  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  25.64 
 
 		 214 aa  53.5  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4294  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 		 220 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  33.97 
 
 		 198 aa  53.1  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  30.86 
 
 		 221 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>