259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0711 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  100 
 
 
348 aa  690    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  99.14 
 
 
362 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  99.43 
 
 
362 aa  687    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  99.14 
 
 
362 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  99.71 
 
 
381 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  99.71 
 
 
381 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  95.42 
 
 
346 aa  631  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  72.21 
 
 
362 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  71.06 
 
 
342 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  70.11 
 
 
348 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  70.11 
 
 
348 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  70.11 
 
 
341 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  69.91 
 
 
373 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  70.77 
 
 
349 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  70.81 
 
 
338 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  69.65 
 
 
339 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  67.89 
 
 
321 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  40.73 
 
 
351 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  41.61 
 
 
345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 
325 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 
325 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  39 
 
 
326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  40.84 
 
 
332 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  37.14 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  35.81 
 
 
331 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  37.69 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  35.06 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  37.97 
 
 
312 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  35.98 
 
 
330 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  37.38 
 
 
330 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  36.21 
 
 
334 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  35.85 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  34.49 
 
 
334 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 
329 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  34.58 
 
 
330 aa  165  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  35.33 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  35.33 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  35.33 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  35.33 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  35.33 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  35.33 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  35.33 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  33.55 
 
 
325 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  36.3 
 
 
322 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  34.19 
 
 
328 aa  153  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 
331 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  32.07 
 
 
324 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  34.59 
 
 
330 aa  143  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  33.55 
 
 
319 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  32.3 
 
 
311 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  34.49 
 
 
309 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  31.43 
 
 
294 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  29.69 
 
 
268 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  31.72 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  32.35 
 
 
245 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  28.77 
 
 
212 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  30 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  27.59 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  26.84 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  30.82 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  27.78 
 
 
208 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  28.32 
 
 
199 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  32.9 
 
 
213 aa  63.2  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.22 
 
 
209 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  27.97 
 
 
199 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.75 
 
 
457 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  26.09 
 
 
206 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  23.56 
 
 
702 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  28.77 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  26.17 
 
 
201 aa  58.5  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  30.77 
 
 
204 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  23.94 
 
 
204 aa  57.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  27.18 
 
 
228 aa  57.4  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  27.96 
 
 
204 aa  57  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  27.49 
 
 
198 aa  56.2  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  26.45 
 
 
197 aa  55.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  22.84 
 
 
204 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  27.97 
 
 
229 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  26.45 
 
 
172 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  28.4 
 
 
220 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.27 
 
 
215 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  26.8 
 
 
202 aa  54.3  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  31.01 
 
 
215 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  26.59 
 
 
219 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  31.01 
 
 
215 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2311  hypothetical protein  24.68 
 
 
199 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  27.27 
 
 
211 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  29.86 
 
 
224 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  26.62 
 
 
224 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
203 aa  53.9  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  26.22 
 
 
211 aa  53.9  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  28.1 
 
 
206 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  31.33 
 
 
215 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  23.03 
 
 
204 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  30.65 
 
 
202 aa  53.5  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  22.5 
 
 
204 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  22.5 
 
 
204 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>