More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5938 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  77.12 
 
 		 322 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  54.23 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  53.85 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  42.95 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  42.72 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  42.95 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  38.65 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  40.13 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  39.8 
 
 		 330 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  40.13 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  40.13 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  40.13 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  37.83 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  37.83 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  37.83 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  37.83 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  37.83 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  37.83 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  37.83 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  38.16 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  35.89 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  35.6 
 
 		 325 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  35.6 
 
 		 325 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  36.65 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  39.8 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  36.2 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  36.45 
 
 		 328 aa  175  8e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  34.59 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  32.68 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  37.19 
 
 		 312 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  32.89 
 
 		 351 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  31.05 
 
 		 325 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  37.33 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  32.45 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  31.27 
 
 		 362 aa  136  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  31.71 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  29.86 
 
 		 321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  32.53 
 
 		 349 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  31.27 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  32.19 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  31.96 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  31.27 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  31.27 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  32.41 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  32.07 
 
 		 348 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  32.07 
 
 		 362 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  32.07 
 
 		 362 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  32.07 
 
 		 362 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  32.07 
 
 		 381 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  32.07 
 
 		 381 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  30.61 
 
 		 339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  37.83 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  32.21 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  30.65 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  29.55 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  28.21 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.88 
 
 		 457 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  32.9 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  30.87 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  32.26 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  28.22 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.05 
 
 		 215 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  29.33 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  25.99 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  28 
 
 		 214 aa  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  28.67 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  23.98 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  28.85 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  28 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  29.14 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  27.56 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  28 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  27.89 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.93 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  21.71 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  28.78 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  26.03 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  34.44 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  26.53 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  26.46 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  25.47 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  29.27 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0201  SNARE associated Golgi protein  25.95 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  24.73 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  25.77 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  24.38 
 
 		 266 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.49 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  26.92 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  26.92 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  26.92 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0366  SNARE associated Golgi protein  30.83 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  28.77 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  22.45 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  26.21 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.87 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  21.88 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  24.77 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>