184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4252 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  93.26 
 
 
341 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  92.53 
 
 
373 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  93.39 
 
 
348 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  100 
 
 
362 aa  723    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  91.98 
 
 
349 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  93.39 
 
 
348 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  91.81 
 
 
342 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  72.49 
 
 
362 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  72.49 
 
 
381 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  72.49 
 
 
362 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  72.49 
 
 
362 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  72.49 
 
 
381 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  72.21 
 
 
348 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  73.02 
 
 
339 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  72.05 
 
 
346 aa  488  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  72.67 
 
 
321 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  72.22 
 
 
338 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  41.88 
 
 
351 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  41.42 
 
 
345 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  39.37 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  39.37 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  40.57 
 
 
332 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  38.61 
 
 
326 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  36.03 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  36.04 
 
 
330 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 
329 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  36.69 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  34.73 
 
 
331 aa  172  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  34.49 
 
 
330 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  33.86 
 
 
330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  34.18 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  34.18 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  34.18 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  34.98 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  35.14 
 
 
312 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  34.44 
 
 
330 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  34.44 
 
 
330 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  34.44 
 
 
330 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  34.44 
 
 
330 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  34.44 
 
 
330 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  34.44 
 
 
330 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  34.44 
 
 
330 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  33.75 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  33.22 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  30.89 
 
 
334 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  32.06 
 
 
325 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  35.49 
 
 
322 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  30.45 
 
 
331 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  31.27 
 
 
324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  32.14 
 
 
319 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  32.89 
 
 
330 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  33.45 
 
 
309 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  31.51 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  33.21 
 
 
294 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  32.88 
 
 
311 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  30.08 
 
 
268 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  28.37 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  33.56 
 
 
213 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 
205 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  28.67 
 
 
199 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  26.76 
 
 
212 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  28.57 
 
 
208 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  25.53 
 
 
212 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  29.41 
 
 
199 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  31.97 
 
 
245 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  27.63 
 
 
202 aa  57  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  28.65 
 
 
228 aa  56.6  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  25.13 
 
 
227 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.29 
 
 
209 aa  56.2  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  26.83 
 
 
219 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  26.96 
 
 
201 aa  55.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.37 
 
 
702 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  25.36 
 
 
209 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  26.13 
 
 
204 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.28 
 
 
215 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  27.21 
 
 
203 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  27.21 
 
 
203 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  26.13 
 
 
204 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  26.13 
 
 
204 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  26.53 
 
 
203 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  22.58 
 
 
204 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.27 
 
 
239 aa  53.1  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  25.15 
 
 
204 aa  52.8  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  23.03 
 
 
204 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  23.03 
 
 
204 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  23.03 
 
 
204 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  23.03 
 
 
204 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  27.61 
 
 
219 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  23.03 
 
 
204 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  23.03 
 
 
204 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  23.03 
 
 
204 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  23.03 
 
 
204 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  26.06 
 
 
229 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  28.68 
 
 
212 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  26.42 
 
 
220 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  28.89 
 
 
220 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  28.76 
 
 
220 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  23.6 
 
 
206 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  23.08 
 
 
204 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  29.33 
 
 
206 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>