More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2688 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  100 
 
 		 206 aa  411  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  94.97 
 
 		 212 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  71.86 
 
 		 202 aa  296  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  66.33 
 
 		 212 aa  271  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  67.58 
 
 		 204 aa  245  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  36.08 
 
 		 220 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  41.72 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  40.51 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  37.36 
 
 		 196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  40.51 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  31.67 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  39.49 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  38.85 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  35.98 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  35.6 
 
 		 220 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  31.11 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  32.45 
 
 		 187 aa  104  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  31.91 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  31.91 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  31.91 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  31.91 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  30.68 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  34 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  34 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  34 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  34.71 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  34 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  33.7 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  34 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  34 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  34 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  36.5 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  36.84 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  36.96 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  36.96 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  36.84 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  33.14 
 
 		 189 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  36.84 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  32.46 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  36.02 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  34.68 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  38.28 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  38.28 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  33.07 
 
 		 179 aa  92.4  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  32.39 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  36.31 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  36.05 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  29.55 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  30.5 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  35.46 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  34.29 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  27.69 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  32.91 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  25 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  29.94 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  30.86 
 
 		 227 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.34 
 
 		 664 aa  70.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.4 
 
 		 671 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  31.65 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  31.65 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.52 
 
 		 702 aa  68.9  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  32.12 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  30.99 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  26.11 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  28.68 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  27.03 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  30.66 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  33.58 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  26.14 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.72 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  31.54 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  32.85 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  26.38 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  31.97 
 
 		 332 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  29.05 
 
 		 345 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  29.75 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  26.06 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  27.54 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  28.92 
 
 		 678 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  28.92 
 
 		 678 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  25.88 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  31.67 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  27.22 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  31.85 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.2 
 
 		 664 aa  63.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  26.95 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  31.21 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  32.35 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  25.29 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  31.29 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  30.66 
 
 		 471 aa  62  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  28.83 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  29.93 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.87 
 
 		 668 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  30.72 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  27.88 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  27.17 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>