More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48660 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  617  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  95.18 
 
 		 311 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  57.47 
 
 		 322 aa  360  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  54.9 
 
 		 324 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  43.32 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  44.19 
 
 		 331 aa  225  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  44.03 
 
 		 319 aa  225  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  40.26 
 
 		 330 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  40.26 
 
 		 330 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  38.83 
 
 		 329 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  42.26 
 
 		 325 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  42.26 
 
 		 325 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  43.18 
 
 		 328 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  38.92 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  38.92 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  39.1 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  38.92 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  39.1 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  42.58 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  38.29 
 
 		 331 aa  205  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  39.62 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  39.43 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  39.43 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  39.43 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  39.43 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  39.43 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  39.43 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  39.43 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  35.5 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  40.73 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  31.6 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  36.6 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  35.86 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  41.82 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  33.45 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  31.17 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  32.64 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  36.42 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  34.93 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  35.25 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  34.93 
 
 		 349 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  34.59 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  34.59 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  34.93 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  34.59 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  34.92 
 
 		 362 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  34.92 
 
 		 348 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  34.92 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  34.59 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  34.92 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  34.92 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  34.92 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  34.93 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  31.54 
 
 		 345 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  32.65 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.57 
 
 		 457 aa  79  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  33.91 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  23.71 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  27.63 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  30.22 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  27.14 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  26.28 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  26.92 
 
 		 237 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  26.67 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  28.14 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  27.13 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  27.14 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  27.62 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  28.83 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  27.14 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  31.95 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  26.9 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  28.83 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  31.52 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  26.63 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  27.27 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  26.49 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  30.72 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  24.62 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  26.13 
 
 		 204 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  32 
 
 		 223 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  27.33 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  28.95 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  26.06 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  28.81 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  27.33 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  27.33 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  27.33 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  27.54 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  27.33 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  29.45 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  25.17 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  27.92 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.88 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  32.18 
 
 		 471 aa  59.7  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  35.04 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  26.81 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>